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Dissertação de Mestrado
DOI
https://doi.org/10.11606/D.87.2011.tde-22032011-174630
Documento
Autor
Nome completo
Mariana Rangel Pereira
Unidade da USP
Área do Conhecimento
Data de Defesa
Imprenta
São Paulo, 2011
Orientador
Banca examinadora
Lemos, Eliana Gertrudes Macedo (Presidente)
Gomes, Eleni
Pellizari, Vivian Helena
Título em português
Prospecção de genes codificadores de enzimas lipolíticas em biblioteca metagenômica de consórcio microbiano degradador de óleo diesel.
Palavras-chave em português
Enzimas lipolíticas
Genética bioquímica
genomas
Lipase
Sequência do DNA
Resumo em português
As enzimas lipolíticas vêm atraindo atenção no mercado global devido ao enorme potencial biotecnológico, como: na formulação de detergentes; na indústria de couro; produção de cosméticos, fármacos, aromas, biodiesel, etc. O objetivo deste trabalho foi prospectar genes codificadores de enzimas lipolíticas em biblioteca metagenômica de um consórcio microbiano degradador de óleo diesel. A seleção foi feita pela atividade lipolítica através do cultivo dos clones em placa de petri e a avaliação foi pela observação de halo ao redor da colônia, sendo positiva para 30 clones dentre os quais dois se destacaram. Estes dois clones foram selecionados e subclonados. Os DNAs das sub-bibliotecas foram sequenciados, gerando um contig completo para cada clone. Através do ORF Finder foi identificado cinco ORFs de esterase/lipase, dentre as quais uma alcançou 58% de identidade com uma bactéria não cultivável. As árvores filogenéticas indicam que duas ORFs são similares à família IV das enzimas lipolíticas, enquanto que as outras três ORFs à família V.
Título em inglês
Screening for lipolytic enzyme codification genes in a metagenomic library of consortia specialized in diesel oil degradation.
Palavras-chave em inglês
Biochemical genetics
DNA sequence
Genomes
Lipase
Lipolytic enzymes
Resumo em inglês
Lipolytic enzymes have been attracting global market attention because they show enormous biotechnological potential. The present work was done as an attempt to find genes which codify lipolytic enzymes in a metagenomic library composed of diesel oil degradation microbe consortia. Clones were selected according to lipolytic activity and were then evaluated after cultivation in Petri dishes by observation of halo formation around the colonies. 30 clones produced halo formations and were identified as positives, two of which showed prominent results. These two were then selected and sub cloned. DNA from the sub libraries was sequenced, generating a complete contig for each clone. Using the ORF Finder five esterase/lipase ORFs were identified, with one of these attaining 58% of identity to a non cultivatable bacteria species. Assessment of the cladograms showed that two ORFs were similar to lipolytic enzyme family IV, while the other three ORFs were similar to family V.
 
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Data de Publicação
2011-08-16
 
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