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Dissertação de Mestrado
DOI
10.11606/D.46.2018.tde-18092018-153959
Documento
Autor
Nome completo
Fabio Passetti
E-mail
Unidade da USP
Área do Conhecimento
Data de Defesa
Imprenta
São Paulo, 2002
Orientador
Banca examinadora
Souza, Sandro José de (Presidente)
Verjovski-Almeida, Sergio
Zanotto, Paolo Marinho de Andrade
Título em português
Diversidade na arquitetura e expressão gênica: uma análise quantitativa de Exon shuffling e splicing alternativo
Palavras-chave em português
Bioinformática
DNA recombinante
Expressão gênica
Genomas (Estudo)
Transcrição gênica
Transcriptoma
Resumo em português
A função e a arquitetura dos genes está começando a ser elucidada a partir do estudo de genomas completos tanto de procariotos como de eucariotos. Diversos estudos foram ultimamente realizados a respeito de exon shuffling do ponto de vista evolutivo, fenômeno relacionado à origem de novos genes através de recombinações de DNA mediadas por introns. Apesar de eventos de exon shuffling serem responsáveis pelo aumento da modularidade gênica, outros processos foram desenvolvidos ao longo da evolução para que houvesse o aumento da diversidade do proteoma sem a conseqüente expansão dos genomas, sendo splicing alternativo um dos mais freqüentes. Apresentamos nesta dissertação duas extensivas análises: 1) a análise de uma base de dados de genes eucarióticos contendo pelo menos um intron que apresentou excesso de introns de fase 0 e exons simétricos, dados que suportam exon shuffling como um importante mecanismo de evolução gênica. Avaliamos também a confiabilidade de introns preditos por programas de computador através de alinhamento de ESTs; e 2) a análise do uso alternativo de exons (UAE), um tipo de splicing alternativo, em transcritos humanos detectando que cerca de 51% dos genes humanos possuem mais de uma variante de splicing e que este tipo de processamento pós-transcricional parece ser mais freqüentemente encontrado em tecidos tumorais.
Título em inglês
Diversity in architecture and gene expression: a quantitative analysis of Exon shuffling and alternative splicing
Palavras-chave em inglês
Bioinformatics
Gene expression
Gene transcription
Genomes (Study)
Recombinant DNA
Transcriptome
Resumo em inglês
Abstract not available.
 
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Data de Publicação
2018-09-18
 
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