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Doctoral Thesis
DOI
https://doi.org/10.11606/T.75.2023.tde-17102023-120252
Document
Author
Full name
Thiago Altair Ferreira
Institute/School/College
Knowledge Area
Date of Defense
Published
São Carlos, 2023
Supervisor
Committee
Galante, Douglas (President)
Cuccovia, Iolanda Midea
Hudson, Reuben Hoyt
Mello, Gustavo Frederico Porto de
Sitta, Elton Fabiano
Title in Portuguese
Aspectos eletroquímicos em modelos de fixação de carbono para a emergência da vida na terra primitiva
Keywords in Portuguese
eletrocatálise
eletroquímica
fontes hidrotermais alcalinas
origem da vida
protometabolismo
transdução
Abstract in Portuguese
Os sistemas vivos apresentam, de modo geral, certa especificidade cinética e termodinâmica nos seus processos vitais. Universalmente, a força motriz de gradientes quimiosmóticos e eletroquímicos naturais em células são acoplados a diversas vias metabólicas por sistemas enzimáticos. Dada esta característica, há o chamado modelo das fontes hidrotermais alcalinas para a emergência da vida na Terra primitiva. Neste, é defendido que a especificidade citada pode ter análogos em sistemas geológicos, as fontes hidrotermais alcalinas (FHA), cujo arranjo de componentes minerais e parâmetros físico-químico pode ter sido o requisito para a emergência dos mecanismos da vida na Terra prebiótica. Propomos, portanto o estudo eletroquímico desta hipótese para a emergência da vida. O trabalho se foca no conceito da interface entre fonte hidrotermal e o oceano primitivo, e na redução de CO2 conforme modelos de transdução pela da via de acetil-CoA (Wood-Ljungdahl, WL), uma via universalmente presente no genoma dos seres vivos conhecidos. Para este estudo, abordamos o uso de minerais de ferro, de estrutura similar a sítios ativos de enzimas, em condições de gradientes eletroquímicos, de temperatura e pH, condição característica da interface geológica citada. Foi primeiramente realizada uma revisão da literatura do modelo FHA focando em trabalhos experimentais e nas principais questões sobre emergência da vida que o modelo busca responder. Desenvolvemos, então, protocolos experimentais detalhados e reprodutíveis que serviram para obtermos resultados e abrem para trabalhos futuros que visem explorar novas propostas que vêm sendo apresentadas na literatura da área. Obtivemos resultados experimentais usando de técnicas como a voltametria cíclica e de espectroscopia de impedância eletroquímica. A partir destas, tivemos informações sobre a estabilidade e atividade de diferentes minerais de ferro, apresentados em trabalhos na literatura no contexto do modelo das FHA, para formação de intermediários da via WL. Os resultados também abrem para estudo do mecanismo de transferência eletrônica que pode ter se dado naquela interface e pode ter envolvido diferentes fases de minerais de ferro.
Title in English
Eletrochemical aspects of models of carbon-fixation for the emergence of life on early earth
Keywords in English
alkaline hydrothermal vents
electrocatalysis
electrochemistry
origins of life
protometabolism
transduction
Abstract in English
Living systems generally exhibit a certain kinetic and thermodynamic specificity in their vital processes. Universally, the driving force of natural chemiosmotic and electrochemical gradients in cells are coupled to diverse metabolic pathways by enzymatic systems. Considering this characteristic, there is the so-called alkaline hydrothermal vents model for the emergence of life on the early Earth. According to that hypothesis, the cited specificity may have analogues in geological systems, the alkaline hydrothermal vents (AHVs), whose arrangement of mineral components and physicochemical parameters may have been the requirement for the emergence of mechanisms of life on the prebiotic Earth. We, therefore, propose the electrochemical study of that model for the emergence of life. This work focuses on the concept of the interface between hydrothermal vent and the early ocean, and the CO2 reduction according to transduction models based on the acetyl-CoA (Wood-Ljungdahl, WL) pathway, which is universally present in the genome of known living things. For this study, we approached the use of iron minerals, similar in structure to enzyme active sites, under conditions of electrochemical, temperature, and pH gradients, typical condition of the aforementioned geological interface. We first conducted a literature review of the AHV model focusing on experimental work and on the main questions about emergence of life that the model currently seeks to answer. We then developed detailed and reproducible experimental protocols that served to obtain results and open for future work aimed at exploring new proposals that have been presented in the literature of the area. We obtained experimental results using techniques such as cyclic voltammetry and electrochemical impedance spectroscopy. From these, we had information about the stability and activity of different iron minerals, presented in the literature in the context of the AHV model, for the formation of intermediates of the WL pathway. The results also open for study of the electron transfer mechanism that may have taken place at that interface and may have involved different phases of iron minerals.
 
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Release Date
2025-08-17
Publishing Date
2023-10-18
 
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