A encefalite viral é um processo inflamatório agudo e frequentemente difuso do parênquima cerebral. Na maioria das vezes, há acometimento associado das meninges e do espaço subaracnóideo. O objetivo deste estudo foi avaliar a prevalência de encefalite viral por arbovírus das famílias Togaviridae e Flaviviridae em São Paulo, Brasil. Um total de 500 amostras de líquido cefalorraquidiano (LCR) coletadas entre agosto de 2012 e janeiro de 2013, de pacientes com sintomas de encefalite aguda foram analisadas. Achados sugestivos de encefalite viral - elevações na concentração celular, glicose e proteína total - foram observados em 234 (46,8%) amostras, designadas como Grupo 1. As 266 amostras restantes compuseram o Grupo 2. Todas as amostras foram testadas para Flavivírus (vírus da dengue 1, 2, 3 e 4, vírus da febre amarela e vírus do Nilo Ocidental), Alphavirus (região NS5) e enterovírus por RT-PCR e para herpesvírus e enterovírus usando Enterpex-CLART. Um agente etiológico viral presuntivo foi detectado em 26 amostras (5,2%), 18 (8,0%) no Grupo 1 e 8 (3,0%) no Grupo 2. No Grupo 1, herpesvírus humanos foram detectados em 9 casos, enterovírus em 7 casos, dengue vírus (DENV) em 2 CSFs e vírus da encefalite de St. Louis (SLEV) em um caso. No Grupo 2 havia 3 CSFs positivos para herpesvírus humanos, 2 para enterovírus, 2 para DENV e 1 para SLEV. A detecção de arbovírus, embora presente em uma minoria de pacientes infectados identificam esses vírus como possível agente etiológico da encefalite. Esta é uma preocupação especial em regiões onde esta classe de vírus é endêmica e tem sido associada a outras epidemias recentes

Viral encephalitis is an acute and often diffuse inflammatory process of cerebral parenchyma. The objective of this study was to evaluate the prevalence of viral encephalitis due to arbovirus infection of the Togaviridae and Flaviviridae families in São Paulo, Brazil. A total of 500 cerebrospinal fluid (CSF) samples collected between August 2012 and January 2013, from patients with symptoms of acute encephalitis were analyzed. Findings suggestive of viral encephalitis-elevations in cell concentration, glucose and total protein-were observed in 234 (46.8%) samples, designated as Group 1. The remaining 266 samples comprised Group 2. All samples were tested for Flaviviruses (dengue virus 1, 2, 3 and 4, yellow fever virus and West Nile virus), Alphavirus (NS5 region) and enterovirus by RT- PCR and for herpesviruses and enteroviruses using CLART-Entherpex. A presumptive viral etiological agent was detected in 26 samples (5.2%), 18 (8.0%) in Group 1 and 8 (3.0%) in Group 2. In Group 1 human herpesviruses were detected in 9 cases, enteroviruses in 7 cases, dengue viruses (DENV) in 2 CSFs and St. Louis encephalitis virus (SLEV) in one case. In Group 2 there were 3 CSFs positive for human herpesviruses, 2 for enteroviruses, 2 for DENV and 1 for SLEV. Detection of arboviruses, even though present in a minority of infected patients, identifies these viruses as a probable etiological agent of encephalitis. This is of special concern in regions where this class of viruses is endemic and has been linked to other recent epidemics