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Doctoral Thesis
DOI
https://doi.org/10.11606/T.5.2023.tde-28022024-161236
Document
Author
Full name
Lívia Caroline Mariano Compte
E-mail
Institute/School/College
Knowledge Area
Date of Defense
Published
São Paulo, 2023
Supervisor
Committee
Rocha, Vanderson Geraldo (President)
Kerbauy, Lucila Nassif
Rego, Eduardo Magalhães
Lima, Alberto Cardoso Martins
Title in Portuguese
Estudo da genotipagem KIR por sequenciamento de nova geração em doadores HLA compatíveis e o impacto nos desfechos pós-transplante de células-tronco hematopoiéticas
Keywords in Portuguese
Células matadoras naturais
Neoplasias hematológicas
Receptores de células matadoras naturais tipo imunoglobulina
Seleção de doador
Sequenciamento de nucleotídeos em larga escala
Transplante de células-tronco hematopoiéticas
Abstract in Portuguese
O transplante de células-tronco hematopoiética alogênico (aloTCTH) é uma opção curativa para diversas neoplasias hematológicas, porém a recaída ainda é um desafio. Células natural killer (NK) mediam a resposta imune inata e tem uma contribuição importante no efeito enxerto versus leucemia. O impacto das células NK por meio da interação entre os seus receptores e respectivos ligantes nos desfechos do aloTCTH tem sido estudado por diferentes modelos baseados na genotipagem dos genes dos receptores imunoglobulina-like (KIR) e dos antígenos leucocitários humano (HLA), entretanto os dados são controversos. Nosso objetivo foi avaliar o impacto da genotipagem KIR de doadores usando o sequenciamento de nova geração em desfechos pós-aloTCTH não mieloablativo (NMA). Métodos: foram avaliados 343 pacientes adultos com neoplasias hematológicas submetidos a aloTCTH com regime de condicionamento não mieloablativo TLI-ATG de doadores HLA compatíveis aparentados e não aparentados (10/10) entre 2007 e 2017. A genotipagem KIR foi realizada usando sequenciamento de nova geração e a pipeline PING. O desfecho primário foi recaída em 2 anos; desfechos secundários foram sobrevida global (SG), mortalidade não relacionada à recaída (MNR), doença do enxerto contra o hospedeiro aguda grau II-IV (DECHa) e crônica (DECHc). Resultados: A idade mediana foi de 61 anos (22-77y) e 57,7% eram do sexo masculino. Leucemia mieloide aguda (N=108) foi o diagnóstico mais frequente, correspondendo a 60% das neoplasias mieloides (N=180), seguida por linfoma não Hodgkin (N=96), síndrome mielodisplásica (N=72), leucemia linfocítica crônica (N=46) e linfoma de Hodgkin (N=21). A mediana de seguimento foi de 7 anos (IC 95% 6,1-7,8). A incidência acumulada de recaída em 2 anos foi 45,2% (IC 95%, 40,2-50,8), DECH aguda grau II-IV e crônica foram 12,8% (IC 95%, 9,7-16,9) e 32,1% (IC 95%, 27,5-37,4), respectivamente. Sobrevida global e sobrevida livre de progressão estimadas em 2 anos foram 62,7% (IC 95%, 57,3-67,6) e 50,6% (IC 95%, 45,1-55,9). O genótipo KIR não teve associação com incidência acumulativa de recaída, SG, MNR, DECHa grau II-IV e DECHc. O número de cópias dos genes KIR2DS1, KIR2DS2, KIR2DS4, KIR3DS1 e KIR3DL1 não teve associação com recaída pós- transplante. Nas doenças mieloides, o par doador-receptor com interação inibitória fraca pelo modelo KIR3DL1/Bw4 e o score KIR inibitório funcional modificado 2 foram associados com menor SG, mas não houve significância estatística no modelo de regressão multivariada (mCF_KIR score: HR, 1,41 IC 95% 0,97-2,05, p=0,07). Na doença linfoide, o modelo receptor ligante foi um preditor independente de recaída (HR, 1,72 IC 95% 1,02 2,92, p=0,04). Entre os dois alelos mais comuns de KIR2DL2, a presença do alelo KIR2DL2*001 resultou numa maior incidência de recaída quando comparado a KIR2DL2*003 (HR, 2,07 IC 95% 1,02-4,18, p=0,04). Os alelos mais comuns de KIR3DL1, KIR2DL3 e KIR2DS1 não foram associados à recaída e sobrevida global. Conclusão: Neste estudo retrospectivo em adultos submetidos a aloTCTH com doadores HLA compatíveis e condicionamento NMA associado com ATG, o score CF-iKIR modificado mostrou tendência de associação com sobrevida global para as doenças mieloides e o modelo receptor ligante esteve associado ao risco de recaída em doenças linfoides. Estudos utilizando NGS em coortes maiores ainda são necessários para definir como a genotipagem KIR deve ser incorporada nos algoritmos de seleção de doador
Title in English
KIR genotyping by next generation sequencing in HLA-matched related and unrelated donors and the impact in outcomes after allogeneic stem cell transplantation for hematological malignancies
Keywords in English
Donor selection
Hematologic malignancies
Hematopoietic stem cell transplantation
High-throughput Nucleotide Sequencing
Killer cells Natural
Receptors KIR
Abstract in English
Allogeneic hematopoietic stem cell transplantation is a curative option for several hematologic neoplasms, but relapse is still a challenge. Natural killer (NK) cells mediate early innate immune response and have an important contribution to graft versus leukemia effect. The impact of NK cells through receptors and ligands interaction in alloHSCT outcomes have been studied by different models based on killer cell immunoglobulin-like receptors (KIR) and human leukocyte antigen (HLA) genotyping and data keeps controversy. Our aim was to evaluate the impact of donor KIR genotyping typing using NGS technology in outcomes after nonmyeloablative alloHSCT. Methods: 343 adult patients underwent alloHSCT with TLI- ATG non-myeloablative conditioning regimen for hematologic neoplasms from a matched related and unrelated donor between 2007 and 2017. Donor KIR genotyping was performed using next generation sequencing and PING pipeline. Primary endpoint was relapse in 2 years; secondary endpoints were overall survival (OS), nonrelapse mortality (NRM), grade II-IV acute and chronic graft versus host disease (GVHD). Results: The median age of the patients was 61 years (22-77y) and 57.7% were male. Acute myeloid leukemia (N=108) was the most frequent diagnosis, making up 60% of myeloid neoplasms (N=180), followed by non-Hodgkin lymphomas (N=96), myelodysplastic syndrome (N=72), chronic lymphocytic leukemia (N=46) and Hodgkin lymphoma (N=21). The median follow-up time was 7.0 years (95% CI, 6.1 7.8). The 2-year cumulative incidence of relapse was 45.2% (95% CI, 40.2-50.8), grade II to IV acute GVHD and chronic GVHD were 12.8% (95% CI, 9.7-16.9) and 32.1% (95% CI, 27.5- 37.4), respectively. Estimate OS and PFS were 62.7% (95% CI, 57.3-67.6) and 50.6% (95% CI, 45.1-55.9) at 2 years. Donor KIR centromeric and telomeric genotype was not associated with relapse, OS, NRM, grade II-IV acute GVHD and chronic GVHD. Copy number of genes KIR2DS1, KIR2DS2, KIR2DS4, KIR3DS1 and KIR3DL1 did not associated with relapse. For myeloid disease, weak inhibition pairs of KIR3DL1/Bw4 model and a modified inhibitory KIR score 2 were associated with lower OS but were not statistically significant in a multivariate regression model (mCF_KIR score: HR, 1.41 95% CI, 0.97-2.05, p=0.07). For lymphoid disease, the missing ligand model was an independent predictor of relapse (HR, 1.72 95% CI, 1.02 2.92, p=0.04). Among the most common KIR2DL2 alleles, presence of KIR2DL2*001 resulted in a higher incidence of relapse compared to KIR2DL2*003 (HR, 2.07 95% CI, 1.02- 4.18, p=0.04). Different KIR3DL1, KIR2DL3 and KIR2DS1 most frequent alleles were not associated with differences in relapse and OS. Conclusions: In this retrospective study in adults undergoing alloHSCT with HLA-compatible donors and NMA conditioning associated with ATG, the modified CF-iKIR score showed an association trend with overall survival for myeloid diseases and the receptor-ligand model was associated with relapse risk in lymphoid diseases. Studies using NGS in larger cohorts are still needed to define how KIR donor typing should be incorporated into donor selection algorithms
 
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Publishing Date
2024-03-04
 
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