O vírus SARS-CoV-2 surgiu na China em 2019, com altos níveis de propagação, e três anos após o início da pandemia é responsável por 670 milhões de casos reportados. Apesar da baixa letalidade já provocou 6,8 milhões de mortes. A entrada do SARS-CoV-2 nas células hospedeiras é mediada pela ligação da enzima conversora de angiotensina-2 (ECA2) com a região Receptor Binding Domain (RBD) localizada na Subunidade S1 da glicoproteína Spike, região alvo de anticorpos neutralizantes. Com essas informações em mente, mapeamos os anticorpos para a proteína RBD presentes no soro de 71 pacientes convalescentes da primeira onda de COVID-19 e de 18 indivíduos vacinados seguindo o regime vacinal de duas doses de Coronavac seguidas de um booster com a vacina miRNA-273. Visamos definir o perfil imunológico destes indivíduos e identificar possíveis peptídeos imunodominantes e a correlação com os títulos de anticorpos neutralizantes. Para isso, utilizamos os seguintes métodos: ELISA para detecção de anticorpos IgG anti RBD, ensaio de neutralização viral (VNT) para detecção de anticorpos neutralizantes e ensaio de microarray para identificar peptídeos específicos da proteína. Parte de nossos resultados mostraram consonância com a literatura: correlação positiva entre títulos de RBD e neutralização. De forma inédita, detectamos um grupo de epítopos imunodominantes reconhecidos por mais de 30% dos indivíduos, que diferem entre as coortes e estão dentro de regiões conservadas entre os betacoronavírus. Destes, apenas um peptídeo, P44 (S415-429), foi reconhecido por 68% dos convalescentes e apresentou reatividade IgG e IgA correlacionada com os títulos de anticorpos neutralizantes, sugerindo que essa é uma região importante na RBD e potencial alvo de atividade neutralizante. Esse peptídeo faz contato com a ECA2 e abriga o sítio de mutação K417 presente nas variantes Beta, Gamma e Ômicron. O perfil de epítopos dos indivíduos vacinados se difere dos convalescentes, sendo mais diverso. Ainda, as regiões imunodominantes reconhecidas pelos vacinados coincidem com os sítios de mutação encontrados na variante Ômicron BA.1, que emergiu após a vacinação. Nossos dados mostram que a pressão imunológica exercida pelos anticorpos imunodominantes podem favorecer a seleção de mutações e a posterior seleção de variantes capazes de evadir a resposta imune

The SARS-CoV-2 virus emerged in China in 2019, with high levels of transmission, and three years after the start of the pandemic, it has been responsible for 670 million reported cases. Despite its low lethality, it has already caused 6.8 million deaths. The entry of SARS-CoV-2 into host cells is mediated by the binding of the angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) to the Receptor Binding Domain (RBD) region located in the S1 Subunit of the Spike glycoprotein, a target region of neutralizing antibodies. With this information in mind, we mapped the antibodies against the RBD protein present in the serum of 71 COVID-19 convalescent patients and 18 vaccinated following the two-dose vaccine regimen of two Coronavac doses followed by a booster with miRNA-273 vaccine to define the immunological profile of these individuals and identify possible immunodominant peptides that could indicate a biomarker. To do this, we used the following methods: ELISA assay for the detection of anti-RBD IgG antibodies, viral neutralization assay (VNT) for the detection of neutralizing antibodies and a microarray assay to identify specific peptides of the protein. Our results were consistent with the literature: a positive correlation between RBD titers and neutralization. We detected a group of immunodominant epitopes recognized by more than 30% of individuals, which differ between cohorts and are within conserved regions among betacoronaviruses. Of these, only one peptide, P44 (S415-429), was recognized by 68% of convalescents and showed IgG and IgA reactivity correlated with neutralizing antibody titers, suggesting that this is an important region in the RBD and a potential target for neutralizing activity. This peptide is localized within a contact region with the ACE2 receptor and harbors the K417 mutation site present in the Beta, Gamma, and Omicron variants. The epitope profile of vaccinated individuals is different from convalescents, with a more diverse repertoire. Furthermore, the immunodominant regions recognized by vaccinees coincide with the mutation sites found in the Omicron BA.1 variant, which emerged after mass vaccination. Our data show that immune pressure induced by immunodominants antibodies may favor mutation in hotspots and subsequent selection of variants capable of evading the immune response