O início de uma nova doença, cujo epicentro se deu em Wuhan - China - com sintomas similares a de uma pneumonia com alto potencial de disseminação, fez com que a Organização Mundial de Saúde decretasse o status de pandemia a está nova doença, chamando a, então, de COVID-19. O agente causador dessa doença foi identificado como um vírus da família coronoviridae denominado SARS-CoV-2. Tal patógeno apresenta como seu órgão alvo o pulmão, instalando um dano alveolar difuso e consequentemente a falência respiratória aguda levando milhares de pessoas a óbito através do mundo. Assim como outros vírus da família coronoviridae, o SARS-CoV-2 utiliza-se de receptores ACE2 e TMPRSS para ligar-se as células do hospedeiro, apresentando assim intenso tropismo por tecidos epiteliais. Neste racional o objetivo deste trabalho foi aprofundar o conhecimento sobre as interações do SARS-CoV-2 e os nichos epiteliais da cavidade oral a partir de autópsias de pacientes que foram a óbito por complicações da COVID-19, desenvolvendo novas metodologias de coletas e reflexões sobre o papel desta técnica na odontologia com diferentes ensaios. Foram realizadas 40 autopsias minimamente invasivas, coletando múltiplos sítios da cavidade oral com o intuito de identificar e caracterizar a presença do SARS-CoV-2 em tecidos de glândulas salivares e periodonto, assim como, avaliar clinicamente potenciais lesões orais. Por fim, avaliar a interação de agentes descontaminantes do vírus nos tecidos da cavidade oral e demonstrar a importância da utilização das autopsias para a odontologia em diversas abordagens metodológicas. Foram realizadas análises biomoleculares dos tecidos glandulares e periodontais sendo as amostras positivas em 5/7 periodontos e 22/35 das glândulas salivares maiores e 80% das menores. A avaliação IHC anti-SARS-CoV-2 foi positiva 55% dos casos. As reações de imunopostividade para os receptores ACE2 e TMPRSS2 foram francamente positivas em todos os casos de tecido periodontal e glândulas salivares. As avaliações das lesões orais se mostraram majoritariamente como coinfecções decorrentes da deterioração da saúde geral dos pacientes. Visto a cinética viral nos nichos orais, os relatos de casos corresponderam com o racional viral, não tendo capacidade sustentada de erradicar o vírus das amostras avaliadas. A utilização das autópsias para avaliação dos tecidos orais se mostrou uma técnica segura e que permite uma avaliação ampla das amostras, assim como, das interações do mesmo com outros órgãos

Resume: The beginning of a new disease, in Wuhan China that presents pneumonia symptoms and high transmissibility, made the World Health Organization decree a pandemic status, calling this disease COVID-19. The pathogen of this disease was a new virus, named SARS-CoV-2. The viruss main targets are the lung epithelial cells causing diffuse alveolar damage and consequently respiratory distress, leading thousands of people to death. Like other coronaviridae viruses, the SARS-CoV-2 uses ACE2 and TMPRSS2 receptors to bond into membrane host cells, showing intense epithelial tropism. The aim of this research is to understand and create knowledge about the relation between the SARS-CoV-2 and oral epithelial niches based on autopsies from COVID-19 deceased patients, developing new sample methodologies and insights about the autopsy role in dentistry in several methodological approaches. We performed 40 minimally invasive autopsies, sampling multiple oral cavity sites aiming to identify and characterize the SARS-CoV-2 presence in salivary glands and periodontal tissues, as well as, evaluate some clinically evident oral lesions. Finally, evaluate the decontaminate potential from chemical agents and show the value of autopsies in dentistry science. We did analyze tissues from salivary glands and gingiva using biomolecular assays that resulted positive for SARSCoV-2 in 5/7 periodontal tissues and 22/35 major salivary glands and 80% of minor ones. The immunohistochemistry analysis showed positivity in 55% of the cases. Immunopositivity for ACE2 and TMPRSS2 was frankly positive in all cases involving periodontal and glandular tissue. The evaluation of oral lesions showed in the vast majority as coinfections that appear in recurrence of the poor health status of the patients. The case reports using different methods of decontamination showed transient results, with recontamination during time in the analyzed sample. The use of autopsies to evaluate oral samples seems to be a secure method and allows us an overview of oral and systemic health, the use of new biomolecular techniques must be employed for further validation of new diseases using samples coming from deceased patients