• JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
 
  Bookmark and Share
 
 
Mémoire de Maîtrise
DOI
https://doi.org/10.11606/D.5.2021.tde-20102021-144714
Document
Auteur
Nom complet
Gleiciele Alice Vieira Silva
Adresse Mail
Unité de l'USP
Domain de Connaissance
Date de Soutenance
Editeur
São Paulo, 2021
Directeur
Jury
Mandelbaum, Karina Lezirovitz (Président)
Levy, Débora
Pardono, Eliete
Tsuji, Robinson Koji
Titre en portugais
Estabelecimento de linhagem de células-tronco de pluripotência induzida (iPSC) de pacientes com perda auditiva hereditária
Mots-clés en portugais
Células-tronco pluripotentes induzidas
Duplicação gênica
Fisiopatologia auditiva
Perda auditiva
Superexpressão
Surdez não-sindrômica
Resumé en portugais
A perda auditiva afeta mais de 466 milhões de pessoas em todo o mundo, sendo considerado o defeito sensorial mais frequente em humanos. O estudo dos genes de surdez tem contribuído no conhecimento da fisiologia auditiva e no desenvolvimento de novas estratégias terapêuticas. Porém, ainda há uma fração considerável de genes de surdez a serem identificados e novas vias biológicas a serem reveladas. O mapeamento desses genes em grandes famílias levou ao conhecimento de mais de uma centena de loci gênicos relacionados à surdez hereditária, incluindo o DFNA58 (2p12-p21), mapeado em 2009 pela orientadora deste estudo. Após o mapeamento do locus DFNA58, foi identificada uma duplicação de ~200Kb por meio de sequenciamento do exoma, dentro da região cromossômica candidata mapeada, cuja co-segregação com a perda auditiva não-sindrômica sensorioneural pós-lingual e progressiva de herança autossômica dominante foi confirmada na família. A duplicação inclui três genes codificadores de proteína, dois inteiros (PLEK e CNRIP1) e o exon 1 de PPP3R1, cuja expressão foi confirmada na cóclea, além disso de quatro outros genes menos caracterizados. Ensaios de RT-qPCR a partir de células monononucleares do sangue dos portadores da duplicação revelaram superexpressão de três dos genes duplicados. No entanto, não há como saber se o mesmo padrão alterado também ocorre na cóclea. Dessa forma, para contribuir na elucidação do papel dessa duplicação (e de seus genes envolvidos) na fisiologia auditiva e por consequência, na surdez, esse estudo teve como objetivo criar um modelo celular experimental, por meio do estabelecimento de linhagens de células-tronco de pluripotência induzida (iPSC) a partir das células mononucleares do sangue periférico dos pacientes dessa família afetados por surdez e portadores desta duplicação e, também dos normouvintes, não portadores desta duplicação. Estabelecidas as linhagens, verificar se as linhagens de iPSC derivadas dos afetados possuem a duplicação e o mesmo padrão de expressão alterado observado nas células mononucleares do sangue dos indivíduos com duplicação. Para isso, foram utilizados vetores epissomais a fim de induzir a reprogramação de células mononucleares de sangue periférico a iPSC. Foram obtidas três linhagens iPSC, uma sem duplicação e duas com duplicação, que se mostraram pluripotentes e com potencial de se diferenciarem em células dos três tecidos dos folhetos embrionários. Além disso, o rastreamento dos vetores utilizados na reprogramação revelou que as linhagens estão livres de integração após a quinta passagem. O padrão de expressão alterado visto no sangue também estava presente nas iPSC, porém um quarto gene, de lncRNA, se mostrou muitas vezes superexpresso nas linhagens dos indivíduos com duplicação em relação aos sem duplicação, corroborando a nossa hipótese de que o padrão de expressão na cóclea pode não refletir o que observamos em outros tipos celulares. Em resumo, foi estabelecido um modelo celular fundamental que, por meio da diferenciação em células fenotipicamente semelhantes às encontradas no epitelio sensorial auditivo, poderá auxiliar nos estudos sobre os efeitos da duplicação nas vias biológicas cruciais na audição
Titre en anglais
Establishment of induced pluripotency stem cell line (iPSC) of patients with hereditary hearing loss
Mots-clés en anglais
Auditory pathophysiology
Gene duplication
Hearing loss
Induced pluripotent stem cells
Non-syndromic hearing loss
Overexpression
Resumé en anglais
Hearing loss is considered the most common sensory defect in humans, affecting more than 466 million people worldwide. The study of hearing loss genes has contributed to the advancing knowledge of auditory physiology and new therapeutic approaches development. However, there is still a considerable fraction of those genes to be identified and new biological pathways revealed. The study of large families in which hearing loss was segregating led to the discovery of more than a hundred genetic loci, including DFNA58 (2p12-p21), mapped in 2009 by our team, associated with non-syndromic, sensorineural, post-lingual progressive hearing loss with autosomal dominant inheritance. Afterward, a ~ 200Kb duplication was identified through exome sequencing within the mapped locus, which cosegregates with hearing loss in the family. The duplication includes three protein-coding genes, two entire (PLEK and CNRIP1) and exon 1 of PPP3R1, from which the expression was confirmed in the cochlea, in addition to five other less characterized genes. RT-qPCR assays from duplication carriers blood mononuclear cells revealed overexpression of three of the duplicated genes. However, whether the same altered pattern also occurs in the cochlea is unpredictable. Thus, in an attempt to elucidate the duplication role (and the involved genes) in the auditory physiology and, consequently, in deafness, this study aimed to create an experimental cell model by establishing induced pluripotency stem cell lines (iPSC) from the peripheral blood mononuclear cells of three female patients from this family, two affected by hearing loss and duplication carriers and one non-carrier normal-hearing. Episomal vectors were used to induce reprogramming of the peripheral blood mononuclear cells into iPSC. Three iPSC lines were obtained, one from an individual without the duplication and two from duplication carriers, which express pluripotent markers and can differentiate into cells of all three germ layers. In addition, the iPSC lines were free of vector integration after the fifth passage. The altered expression pattern seen in the blood was also present in iPSC, but a fourth gene, a lncRNA, showed overexpression in duplication carriers iPSC compared to the non-carrier iPSC, corroborating our hypothesis that the pattern of expression in the cochlea may not resembles what was observed in other cell types. In summary, an essential cellular model was established that, by differentiating into cells phenotypically similar to those found in the auditory sensory epithelium, could finally recapitulate the effects of the duplication on the crucial biological pathways in hearing
 
AVERTISSEMENT - Regarde ce document est soumise à votre acceptation des conditions d'utilisation suivantes:
Ce document est uniquement à des fins privées pour la recherche et l'enseignement. Reproduction à des fins commerciales est interdite. Cette droits couvrent l'ensemble des données sur ce document ainsi que son contenu. Toute utilisation ou de copie de ce document, en totalité ou en partie, doit inclure le nom de l'auteur.
Date de Publication
2021-10-25
 
AVERTISSEMENT: Apprenez ce que sont des œvres dérivées cliquant ici.
Tous droits de la thèse/dissertation appartiennent aux auteurs
CeTI-SC/STI
Bibliothèque Numérique de Thèses et Mémoires de l'USP. Copyright © 2001-2024. Tous droits réservés.