• JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
 
  Bookmark and Share
 
 
Disertación de Maestría
DOI
https://doi.org/10.11606/D.5.2022.tde-01022023-092430
Documento
Autor
Nombre completo
Victor Hugo Calegari de Tolêdo
Dirección Electrónica
Instituto/Escuela/Facultad
Área de Conocimiento
Fecha de Defensa
Publicación
São Paulo, 2022
Director
Tribunal
Brentani, Helena Paula (Presidente)
Oliveira, Karina Griesi
Shephard, Elizabeth
Simões, Ana Carolina Quirino
Título en portugués
Diferenças sexuais nas redes de regulação gênica durante o período fetal do neurodesenvolvimento
Palabras clave en portugués
Biologia computacional
Córtex cerebral
Desenvolvimento fetal
Diferenciação sexual
Expressão gênica
Fatores de transcrição
Regulação da expressão gênica
Transtornos do neurodesenvolvimento
Resumen en portugués
Transtornos do neurodesenvolvimento apresentam-se de maneira consideravelmente distinta entre indivíduos do sexo masculino e feminino. Além disso, o período fetal do neurodesenvolvimento é o mais crítico para a programação destes transtornos. Estudos transcriptômicos comparando cérebros fetais dos dois sexos demonstram que a maior diferença na expressão gênica acontece em genes de cromossomos sexuais, mas muitos genes autossômicos apresentam uma diferença sutil na expressão que ainda não foi explorada. Com o intuito de investigar vias biológicas que explicam as diferenças sexuais no cérebro fetal, foram utilizados métodos integrativos baseados em princípios da medicina de redes, mais especificamente redes de co-expressão gênica (CEMiTool) e de co-regulação gênica (netZoo). O padrão de expressão gênica dentro de uma via biológica tende a refletir funções e/ou fenômenos biológicos pertinentes. Neste estudo, a análise de redes da expressão gênica de amostras fetais de cérebro humano revela diferenças entre amostras masculinas e femininas. Ao integrar duas ferramentas bioinformáticas distintas, os resultados sugerem que processos biológicos tais como o ciclo celular, a diferenciação celular, o metabolismo energético e a organização da matriz extracelular estão consistentemente associados aos módulos diferencialmente regulados entre os sexos. Por fim, análises de enriquecimento demonstram que essas diferenças são relevantes para transtornos do neurodesenvolvimento, como o autismo
Título en inglés
Sex differences in gene regulatory networks during fetal brain development
Palabras clave en inglés
Cerebral cortex
Computational biology
Fetal development
Gene expression
Gene expression regulation
Neurodevelopmental disorders
Sex differentiation
Transcription factors
Resumen en inglés
Neurodevelopmental disorders differ considerably between males and females, and fetal brain development is one of the most critical periods to determine risk for these disorders. Transcriptomic studies comparing male and female fetal brain have demonstrated that the highest difference in gene expression occurs in sex chromosomes, but several autossomal genes also demonstrate a slight difference that has not been yet explored. In order to investigate biological pathways underlying fetal brain sex differences, we applied medicine network principles using integrative methods such as co-expression networks (CEMiTool) and regulatory networks (netZooR). The pattern of gene expression from genes in the same pathway tend to reflect biologically relevant phenomena. In this study, network analysis of fetal brain expression reveals regulatory differences between males and females. Integrating two different bioinformatics tools, our results suggest that biological processes such as cell cycle, cell differentiation, energy metabolism, and extracellular matrix organization are consistently enriched in differential modules. MSET analysis demonstrates that these differences are relevant to neurodevelopmental disorders, including autism
 
ADVERTENCIA - La consulta de este documento queda condicionada a la aceptación de las siguientes condiciones de uso:
Este documento es únicamente para usos privados enmarcados en actividades de investigación y docencia. No se autoriza su reproducción con finalidades de lucro. Esta reserva de derechos afecta tanto los datos del documento como a sus contenidos. En la utilización o cita de partes del documento es obligado indicar el nombre de la persona autora.
Fecha de Publicación
2023-02-01
 
ADVERTENCIA: Aprenda que son los trabajos derivados haciendo clic aquí.
Todos los derechos de la tesis/disertación pertenecen a los autores
CeTI-SC/STI
Biblioteca Digital de Tesis y Disertaciones de la USP. Copyright © 2001-2024. Todos los derechos reservados.