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Thèse de Doctorat
DOI
https://doi.org/10.11606/T.5.2022.tde-17042023-110531
Document
Auteur
Nom complet
Aléia Faustina Campos
Adresse Mail
Unité de l'USP
Domain de Connaissance
Date de Soutenance
Editeur
São Paulo, 2022
Directeur
Jury
Guimarães, Thais (Président)
Freitas, Marise Reis de
Motta, Fabio de Araujo
Rodrigues, Cristhieni
Titre en portugais
Impacto de um programa de intervenção para uso racional de antimicrobianos associado ao diagnóstico rápido em infecções de corrente sanguínea por bacilos gram-negativos
Mots-clés en portugais
Bactérias gram-negativas
Consumo de antimicrobianos
Gestão de antimicrobianos
Infecção de corrente sanguínea
Mortalidade
Resistência bacteriana
Tempo de internação
Terapêutica
Testes imediatos
Unidades de terapia intensiva
Resumé en portugais
Resumo. A combinação de estratégias para testes de diagnóstico rápido (TDR) com intervenção em tempo real para uso racional de antimicrobianos (ATM) pode melhorar os desfechos em pacientes com infecções de corrente sanguínea (ICS) por bacilos gram-negativos (BGN) em unidades de terapia intensiva (UTIs). O objetivo do estudo foi avaliar o impacto da intervenção de TDR e comunicação rápida em desfechos clínicos e de consumo e custos de antimicrobianos em pacientes com ICS por BGN internados em UTIs. Trata-se de um estudo quase experimental do tipo pré e pós-intervenção realizado nas UTIs do Instituto Central do Hospital das Clínicas (ICHC) durante o período de Março de 2018 a Maio de 2019, período pré intervenção, e de Setembro 2020 a Outubro 2021, período intervenção, sendo incluídos pacientes com ICS por BGN em UTIs. No período pré intervenção foram coletados dados de resultados de testes microbiológicos laboratoriais realizados por metodologia convencional e prescrição do antimicrobiano de forma passiva em prontuário médico eletrônico, sem nenhuma intervenção. No período de intervenção a técnica de Matrix Assisted Laser Desorption Ionization Time of Flight (MALDI-TOF) utilizada para identificação das bactérias passou a ser feita diretamente do frasco da hemocultura positiva, houve comunicação direta do pesquisador com os médicos prescritores para avisar dos resultados microbiológicos (Gram, identificação da espécie e teste de sensibilidade aos antimicrobianos) em tempo real e houve também pesquisa de genes de resistência. A detecção dos genes de resistência foi realizada pela técnica de PCR multiplex através do XGEN MULTI SEPSE FLOW CHIP (Mobius) utilizando o kit para bactérias gram-negativas em associação ao equipamento HybriSpot (HS12 AUTO) diretamente do frasco de hemocultura positivada. Os períodos foram comparados com relação aos desfechos clínicos de mortalidade em 30 dias, tempo de internação hospitalar e na UTI e com relação ao consumo de ATM utilizando-se dias de terapia (DOT) e custos em reais por análise uni e multivariada. Foram incluídos 216 episódios de bacteremia por BGN, sendo 114 no período pré intervenção e 102 no período intervenção. A mediana de idade dos pacientes nos períodos pré intervenção e intervenção foi de 56 anos (41-62) e 59 anos (47-69), p=0,057, respectivamente sendo o sexo masculino mais prevalente em ambos os períodos. No período intervenção, os pacientes eram mais graves (SAPS3= 64, IIQ 50-76) e tivemos a prevalência de pacientes infectados pelo SARS-CoV-2 (44%). A origem da maioria dos isolados no período pré intervenção foram provenientes de ICS primárias (50,8%), seguidas de abdominal (14,9%) e do trato respiratório (11,4%). No período de intervenção a origem das ICS foi primária (47,1%), seguida de infecções do trato respiratório (27,5%) e urinárias (8,8%). A Klebsiella pneumoniae foi a bactéria mais prevalente para ambos os períodos (43% vs. 32,4%, p=0,043) e a distribuição dos patógenos foi semelhante nos dois períodos, exceto pela prevalência significativa maior de Pseudomonas aeruginosa no período intervenção (6,1% vs. 21,6%; p=0,002). A taxa de Enterobactérias resistentes aos carbapenêmicos em ambos os períodos foi semelhante, 24,6% vs. 15,7%, p=0,14, respectivamente. No período intervenção, blaCTX-M foi o gene de resistência mais comumente detectado (68,6%), seguido por blaOXA (41,2%) e blaKPC (27,4%). O estudo não demonstrou impacto na mortalidade em 30 dias entre o período pré intervenção e intervenção, (25% vs 35%; p=0,115), respectivamente. O tempo de permanência no hospital e tempo de permanência na UTI foi significativamente menor no período de intervenção [(44 dias vs. 39 dias; p= 0,005) e (17 dias vs. 13 dias; p= 0,033)], respectivamente. Na análise multivariada para fatores de risco relacionados a mortalidade em 30 dias, somente a infecção pelo SARS Cov-2 demonstrou ser variável independente para esse risco (OR= 1,54, IC95% 1,02-2,29; p=0,036). O tempo médio de duração da terapia antimicrobiana foi significativamente diferente no período pré e intervenção (9,13 vs. 7,8 dias; p=0,013), respectivamente. O tempo para os resultados dos testes microbiológicos (TAT) diretamente do frasco de hemocultura, Gram, MALDI-TOF e teste de sensibilidade, tiveram redução significativa entre os períodos pré e intervenção [(2h43min vs. 1h32min; p< 0,001), (26h31min vs. 9h31min; p<0,001) e 54h14min vs. 48h28min, p=0,005), respectivamente]. O consumo geral de antimicrobianos foi de 1.381 DOT/1.000 dias-presentes no período pré intervenção comparado a 1.262 DOT/1.000 dias-presentes no período de intervenção (p=0,032). Essa redução do consumo geral foi atribuída ao menor uso de antimicrobianos no tratamento de bactérias gram-positivas e ao menor uso da antimicrobianos da classe dos carbapenêmicos [(475 DOT/1.000 dias-presente vs. 270 DOT/1.000 dias-presente; p=0,004) e (836 DOT/1.000 dias-presente vs. 543 DOT/1.000 dias-presente); p=0,04)], respectivamente. Conclui-se que a intervenção do estudo não demostrou impacto na mortalidade em 30 dias, muito provavelmente pela presença da infecção pelo SARS CoV-2 no período intervenção e consequentemente, maior gravidade dos pacientes, o que pode ter contribuído para não redução da mortalidade. Contudo, houve impacto no tempo de internação hospitalar e na UTI, bem como no consumo e custos de antimicrobianos. Houve também diferenças no TAT com a incorporação do MALDI-TOF realizado diretamente do frasco da hemocultura positiva que deve ser incorporado de maneira rotineira pelos laboratórios que utilizam esta técnica. Todas as ferramentas de uso racional de antimicrobiano baseadas em testes de diagnóstico microbiológico rápido e sua comunicação em tempo real aos médicos prescritores, por agregar valor e informações para uma tomada de decisão segura, são estratégias que resultam em benefícios diretos e indiretos relacionados tanto ao uso racional de antimicrobianos e potencial de menor indução de resistência bacteriana como também ao ônus econômico desta classe de medicamentos
Titre en anglais
Impact of an antimicrobial stewardship program intervention associated with the rapid identification of microorganisms in patients with gram-negative bacteremia
Mots-clés en anglais
Antimicrobial consumption
Antimicrobial stewardship
Bloodstream infection
Drug resistance
Gram-negative bacteria
Intensive care units
Length of stay
Mortality
Point-of-care testing
Therapeutics
Resumé en anglais
The combination of rapid diagnostic testing (RDT) strategies with real-time intervention for rational use of antimicrobials (ATM) can improve outcomes in patients with bloodstream infections (BSIs) caused by gram-negative bacteria (GNB) in intensive care units (ICUs). The aim of the study was to assess the impact of RDT intervention and rapid communication on clinical and antimicrobial consumption and cost outcomes in patients with BSIs from GNB admitted to ICUs. This is a quasi-experimental study of the pre- and post-intervention type carried out in the ICUs of the Instituto Central do Hospital das Clínicas (ICHC) during the period from March 2018 to May 2019, pre-intervention period, and from September 2020 to October 2021, intervention period, including patients with ICS due to BGN in ICUs. In the pre-intervention period, data were collected from the results of laboratory microbiological tests performed by conventional methodology and passively prescribed antimicrobials in electronic medical records, without any intervention. During the intervention period, the Matrix Assisted Laser Desorption Ionization Time of Flight (MALDI-TOF) was performed directly from the positive blood culture bottle with direct and real time communication between the researcher and the prescribing physicians to notify the microbiological results (Gram, species identification and antimicrobial sensitivity test). The detection of resistance genes was performed by the multiplex PCR technique through the XGEN MULTI SEPSE FLOW CHIP (Mobius) using the kit for GNB in association with the HybriSpot equipment (HS12 AUTO) directly from the positive blood culture bottle. The periods were compared with respect to clinical outcomes of 30-day mortality, length of hospital and ICU stay and with respect to ATM consumption using days of therapy (DOT) and costs in reais by univariate and multivariate analysis. A total of 216 episodes of BGN bacteremia were included, 114 in the pre-intervention period and 102 in the intervention period. The median age of patients in the pre-intervention and intervention periods was 56 years (41-62) and 59 years (47-69), p=0.057, respectively, with males being more prevalent in both periods. In the intervention period, patients were more severe (SAPS3= 64, IQR 50-76) and we had a prevalence of patients infected with SARS-CoV-2 (44%). The source of most isolates in the pre-intervention period came from primary BSI (50.8%), followed by abdominal (14.9%) and respiratory tract (11.4%). During the intervention period, it was from primary (47.1%), followed by respiratory (27.5%) and urinary tract (8.8%) infections. Klebsiella pneumoniae was the most prevalent bacteria for both periods (43% vs. 32.4%, p=0.043) and the distribution of pathogens was similar in both periods, except for the significantly higher prevalence of Pseudomonas aeruginosa in the intervention period (6.1% vs. 21.6%; p=0.002). The rate of carbapenem-resistant Enterobacteriaceae in both periods was similar, 24.6% vs. 15.7%, p=0.14, respectively. In the intervention period, blaCTX-M was the most detected resistance gene (68.6%), followed by blaOXA (41.2%) and blaKPC (27.4%). The study showed no impact on 30-day mortality between the pre-intervention and intervention periods (25% vs. 35%; p=0.115), respectively. Length of hospital stay, and length of ICU stay were significantly shorter in the intervention period [(44 days vs. 39 days; p=0.005) and (17 days vs. 13 days; p=0.033)], respectively. In the multivariate analysis for risk factors related to 30-day mortality, only SARS Cov-2 infection proved to be an independent variable for this risk (OR= 1.54, 95%CI 1.02-2.29; p=0.036). The mean duration of antimicrobial therapy was significantly different in the pre- and intervention period (9.13 vs. 7.8 days; p=0.013), respectively. The time for the results of microbiological tests (TAT) directly from the blood culture bottle related to Gram, MALDI-TOF and antimicrobial sensitivity test, had a significant reduction between the pre and intervention periods [(2h43min vs. 1h32min; p< 0.001), (26h31min vs. 9h31min; p<0.001) and (54h14min vs. 48h28min, p=0.005), respectively]. Overall antimicrobial consumption was 1,381 DOT/1,000 present days in the pre-intervention period compared to 1,262 DOT/1,000 present days in the intervention period (p=0.032). This reduction in overall consumption was attributed to the lower use of antimicrobials in the treatment of gram-positive bacteria and the lower use of carbapenem-class antimicrobials [(475 DOT/1,000 present days vs. 270 DOT/1,000 present days; p= 0.004) and (836 DOT/1,000 present days vs. 543 DOT/1,000 present days); p=0.04)], respectively. It is concluded that the intervention proposed in this study showed no impact on 30-day mortality, most likely due to the presence of SARS CoV-2 infection in the intervention period and, consequently, greater severity of patients, which may have contributed to the non-reduction of mortality. However, there was an impact on hospital and ICU length of stay, as well as on antimicrobial consumption and costs. There were also differences in TAT with the incorporation of MALDI-TOF performed directly from the positive blood culture bottle, which must be routinely incorporated by laboratories that use this technique. All antimicrobial rational use tools based on RDTs and their communication in real time to prescribing physicians, by adding value and information for safe decision making, are strategies that result in direct and indirect benefits related to both the use rational use of antimicrobials and the potential for lower induction of bacterial resistance as well as the economic burden of this class of drugs
 
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Date de Publication
2023-05-05
 
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