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Master's Dissertation
DOI
https://doi.org/10.11606/D.5.2021.tde-06122021-103022
Document
Author
Full name
Bruna Del Guerra de Carvalho Moraes
E-mail
Institute/School/College
Knowledge Area
Date of Defense
Published
São Paulo, 2021
Supervisor
Committee
Costa, Silvia Figueiredo (President)
Mendes, Elisa Donalisio Teixeira
Doi, André Mario
Song, Alice Tung Wan
Title in Portuguese
Impacto do uso de Lactobacilus plantarum na colonização, na infecção por bactérias multirresistentes e no microbioma de pacientes submetidos a transplante de células tronco hematopoiéticas
Keywords in Portuguese
Microbioma gastrointestinal
Probióticos
Resistência microbiana a medicamentos
RNA ribossômico 16S
Transplante de medula óssea
Abstract in Portuguese
Introdução - A colonização intestinal prévia por bactérias multirresistentes (BMR) é um fator de risco para infecções da corrente sanguínea (ICS) e uma das principais complicações na fase inicial do Transplante de Células-Tronco Hematopoiéticas (TCTH). Avaliamos o impacto do Lactobacillus plantarum na modulação do microbioma intestinal em candidatos ao TCTH colonizados por BMR. Métodos - Amostras de fezes foram obtidas previamente à introdução de L. plantarum e ao TCTH, na segunda semana de uso do L. plantarum, na neutropenia, na semana anterior a infecção e na enxertia do TCTH. Foram incluídos 42 candidatos a TCTH autólogo ou alogênico com diagnósticos oncohematológicos. Os participantes foram alocados em um grupo de intervenção (n=22) que recebeu cápsulas de L. plantarum (5x109 UFC) duas vezes ao dia antes do TCTH até o início da neutropenia e um grupo controle (n=20). A região V4 do gene rRNA bacteriano 16S foi sequenciada em 93 amostras de fezes de um subconjunto de 33 pacientes. Colonização por MDRO foi avaliada por cultura em meio seletivo e PCR para identificação de genes de resistências. Clonalidade dos isolados foi avaliada por PFGE. Resultados A média da adesão à intervenção foi de 86% (±11%) por cerca de 43(±29) dias de consumo. L. plantarum foi seguro, tolerável e associado a um aumento na abundância de Lactobacillales (p = 0,004). Aumento de Lactococcus e redução de Turicibacter foram identificados na segunda semana de uso de L. plantarum. Não houve diferença na redução de BMR entre os grupos, nem um mesmo perfil clonal dos isolados foi identificado entre os pacientes. Foi encontrado maior abundância de Enterococcus no grupo controle na enxertia do TCTH. Diversidades alfa e beta foram alteradas ao longo do procedimento de TCTH, independentemente do uso de L. plantarum. Conclusões - L. plantarum foi seguro e pode, potencialmente, reduzir os níveis fecais do gênero Enterococcus em candidatos a TCTH. No entanto, não mostrou impacto significativo na descolonização por BMR
Title in English
Impact of exogenous Lactobacillus plantarum on the gut microbiome of hematopoietic stem cell transplantation patients colonized by multi-drug resistant bacteria
Keywords in English
Bone marrow transplantation, RNA ribosomal 16S
Drug resistance microbial
Gastrointestinal microbiome
Probiotics
Abstract in English
Background - Previous gut colonization by multidrug resistant organisms(MDROs) is a risk factor for bloodstream infections(BSI) and a major complication in the early phase of Hematopoietic Stem Cell Transplantation(HSCT). We evaluated, in an exploratory study, the impact of Lactobacillus plantarum on modulation of the gut microbiome in HSCT patients colonized by MDROs. Methods - Stool samples were obtained at timed intervals from 42 oncohematological candidates undergoing autologous or allogeneic HSCT. Participants were allocated to na intervention group(IG = 22) who received capsules of L. plantarum(5x109 CFU) twice a day before the HSCT until the onset of neutropenia and a control group(CG= 20). The V4 region of the 16S bacterial rRNA gene in 93 stool samples from a subset of 33 patients was sequenced. Colonization by MDRO was evaluated by culture in a selective medium and PCR to identify resistance genes. Clonality of the isolates was assessed by PFGE. Results - L. plantarum had an average 86%(±11%) drug-target engagement at 43(±29) days of consumption and it was safe, tolerable and associated with an increase in the abundance of the Lactobacillales(p=0.004). Differently abundant bacteria were investigated by LefSe and na increase of Lactococcus and reduction of Turicibacter were identified on the second-week of L. plantarum use. Both the IG and CG exhibited a similar reduction in MDROs; there was not the same clonal profile of the isolates identified among the patients; except Enterococcus abundance which had a greater rise in the CG Alpha and beta diversity measures were altered throughout the HSCT procedure, regardless of L. plantarum usage. Conclusions L. plantarum was safe and may potentially reduce fecal levels of Enterococcus genus in HSCT candidates; however, it has not showed a significant impact on MDRO decolonization
 
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Publishing Date
2021-12-06
 
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