• JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
 
  Bookmark and Share
 
 
Master's Dissertation
DOI
https://doi.org/10.11606/D.46.2020.tde-10052022-152309
Document
Author
Full name
Eduardo Delago Koyanagui
E-mail
Institute/School/College
Knowledge Area
Date of Defense
Published
São Paulo, 2020
Supervisor
Committee
Borin, Antonio Carlos (President)
Galembeck, Sergio Emanuel
Mello, Paula Homem de
Title in Portuguese
Fotofísica da 2(1H)-pirimidinona e 1-metil-2(1H)-pirimidinona
Keywords in Portuguese
1-metil-2(1H)-pirimidinona
2(1H)-pirimidinona
CASPT2
CASSCF
Estado excitado
Físico-química
Abstract in Portuguese
Após absorver radiação ultravioleta, as nucleobases do DNA são excitadas e retornam ao estado fundamental muito rapidamente, em uma escala de tempo de alguns picossegundos ou menos. Moléculas análogas às nucleobases têm tido papel cada vez mais importante como agentes fototerápicos, sondas fluorescentes e como modelos para a descrição de sistemas mais complexos no DNA. Esses análogos também são importantes no entendimento das propriedades ultrarápidas das nucleobases canônicas. O objetivo deste trabalho é explicar as propriedades fotofísicas da 2(1H)pirimidinona (2P) e da 1metil2(1H)pirimidinona (1M2P), especificamente os processos fotofísicos dos estados eletrônicos excitados, populados após absorção de radiação ultravioleta. As propriedades fotofísicas da 2P e 1M2P foram investigadas interpretando a topologia das superfícies de energia potencial, que foram descritas pelos métodos Complete Active-Space Self-Consistent Field (CASSCF) e Complete Active-Space Second-Order Perturbation Theory (CASP2); esses métodos caracterizam equilibradamente diferentes estados eletrô- nicos e regiões distintas das diversas superfícies de energia potencial. O conjunto de funções de bases atômicas usado em todos os cálculos foi o cc-pVDZ. A 2(1H)-pirimidinona, após ser excitada pela luz ultravioleta, decai rapidamente para um ponto estacionário na superfície do estado eletrônico excitado, S1, e a sua fotofísica será determinada a partir desse ponto. O mecanismo consiste em uma competição entre um decaimento eficiente para o estado fundamental e a formação de estados tripletos. O primeiro tipo de decaimento acontecerá após a molécula superar uma barreira energética, acessando uma região de cruzamento triplo entre o estado excitado S1, o estado tripleto T1 e o estado fundamental. Nessa região, o decaimento eficiente para o estado fundamental competirá com a transição para T1. A formação de tripletos será determinada, em adição à transição para T1 no cruzamento entre três estados, por uma região de cruzamento entre S1 e T2, acessada atravessando uma barreira à partir do mínimo do S1. Um mecanismo semelhante é observado para a 1metil2(1H)pirimidinona, com a importante diferença de que o acesso ao estado T2 não depende de atravessar uma barreira, mas da ativação de estados vibracionais no poço de potencial do ponto estacionário do estado S1.
Title in English
Photophysics of 2(1H)-pyrimidinone e 1-metil-2(1H)-pyrimidinone
Keywords in English
1-methyl-2(1H)-pyrimidinone
2(1H)-pyrimidinone
CASPT2
CASSCF
Excited state
Physical chemistry
Abstract in English
After ultraviolet radiation absorption, DNA nucleobases return to the ground state in very fast process, in a timescale of a few picosseconds or less. Canonical nucleobases analogs have received considerable attention due to their role as phototerapeutic agents, fluorescent probes, and also as models for the description of more complex systems. These analogs are also important for better understanding the ultrafast properties of canonical nucleobases. The aim of this work is to explain the photophysical properties of 2(1H)-pyrimidinone (2P) and 1-methyl-2(1H)-pyrimidinone (1M2P), specifically the photophysical processes of the excited electronic states, populated after the absorption of ultraviolet radiation. The photophysical properties of 2P and 1M2P were investigated assessing the topology of the potential energy surfaces, employing the Complete Active-Space Self-Consistent Field (CASSCF) and Complete Active-Space Second-Order Perturbation Theory (CASPT2) methods, which are capable of describing different electronic states in different regions of the potential energy surfaces in a balanced manner. The cc-pVDZ atomic function basis sets were employed in all calculations. 2(1H)-pyrimidinone, after being excited by light, rapidly decays to a stationary point on the electronic excited state potential energy hypersurface, S1, and its photophysics will be determined from this point on. The mechanism consists of a competition between an efficient decay to the ground state and the formation of triplet states. The first type of decay will happen after the molecule overcomes an energy barrier, accessing a region of triple crossing between S1, T1 and the ground state. In this region, the efficient decay to the ground state will compete with the transition to T1. In addition to the transition to T1 in the three state crossing, the triplet formation will be determined by another region, namely a crossing between S1 and T2, reached by overcoming a barrier from the S1 minimum. A similar mechanism is predicted for the 1-methyl-2(1H)-pyrimidinone, although theres an important difference in the access to T2, which does not depend on overcoming a barrier, but on the activation of vibrational excited states in the S1 stationary point potential well.
 
WARNING - Viewing this document is conditioned on your acceptance of the following terms of use:
This document is only for private use for research and teaching activities. Reproduction for commercial use is forbidden. This rights cover the whole data about this document as well as its contents. Any uses or copies of this document in whole or in part must include the author's name.
Publishing Date
2022-06-07
 
WARNING: Learn what derived works are clicking here.
All rights of the thesis/dissertation are from the authors
CeTI-SC/STI
Digital Library of Theses and Dissertations of USP. Copyright © 2001-2024. All rights reserved.