Nesta dissertação foi avaliada a sistemática filogenética de linhagens de Epicoccum spp., incluindo algumas do complexo E. nigrum, à luz de avanços recentes na resolução da história evolutiva do gênero. Além disso, foi avaliada a presença de um gene de uma policetídeo sintase (PKS) potencialmente associada à produção da epicolactona, um composto bioativo de grande interesse pela sua estrutura química, identificado no sobrenadante da cultura E. nigrum P16. Para compreender melhor a relação entre interação e evolução das linhagens, foi testada a correlação entre distância genética e capacidade de inibição de micro-organismos. Foi usada inferência filogenética pelo método de máxima verossimilhança para avaliara abrangência filogenética das linhagens, dentro do gênero Epicoccum. Foram desenhados primers específicos para a KS do gene potencialmente associado à rota de biossíntese da epicolactona e testados em todas as linhagens. Foi realizado um teste de correlação entre as matrizes de distância genética e distância de padrão de inibição qual não demonstrou congruência entre os agrupamentos gerados por estas análises. Os resultados indicam prováveis mudanças na classificação de linhagens do complexo E. nigrum, para gêneros como E. italicum e E. layuense. Também foi observada a presença do gene potencialmente associado à rota de biossíntese da epicolactona em muitas das linhagens de Epicoccum independente da filogenia e do agrupamento gerado pelo padrão de inibição. Adicionalmente, foram obtidos extratos das linhagens para a avaliação de metabólitos secundários os quais estão sendo caracterizados e serão utilizados para gerar uma filogenia baseada em marcadores químicos.

In this dissertation, we evaluated the phylogenetic systematics of Epicoccum spp. streains, including some of the E. nigrum complex, in light of recent advances in the resolution of the evolutionary history of the genus. In addition, the presence of a polyketide synthase gene (PKS) potentially associated with the production of epicolactone, a bioactive compound of great interest for its chemical structure, identified in the culture supernatant of E. nigrum P16, was evaluated. To better understand the relationship between strains interaction and evolution, the correlation between genetic distance and inhibition capacity of microorganisms was tested. Phylogenetic inference using the maximum likelihood method was used to evaluate the phylogenetic range of the strains within the genus Epicoccum. Specific primers were designed for the KS of the gene potentially associated with the epicolactone biosynthesis route and tested in all strains. A correlation test was performed between genetic distance matrix and inhibition pattern distance matrix which did not show congruence among the clusters generated by these analyzes. The results indicate probable changes in the classification of E. nigrum complex strains to genera such as E. italicum and E. layuense. The presence of the gene potentially associated with the epicolactone biosynthesis route, was also observed in many Epicoccum strains independent of the phylogeny and the cluster generated by the inhibition pattern. In addition, extracts of the strains were obtained for the evaluation of secondary metabolites that are being characterized and will be used to generate a phylogeny based on chemical markers.