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Doctoral Thesis
DOI
https://doi.org/10.11606/T.42.2019.tde-13122021-150001
Document
Author
Full name
Luiz Gustavo de Almeida
Institute/School/College
Knowledge Area
Date of Defense
Published
São Paulo, 2019
Supervisor
Committee
Spira, Beny (President)
Gomez, José Gregorio Cabrera
Maldonado, Gabriel Padilla
Silva, Aline Maria da
Soares Netto, Luis Eduardo
Title in Portuguese
Caracterização do mutante phoU de Pseudomonas aeruginosa.
Keywords in Portuguese
phoU
Pseudomonas aeruginosa
fosfato
operon pst
Polifosfato
ppGpp
regulon PHO
Abstract in Portuguese
Uma das características mais notáveis de microrganismos é a capacidade de adaptação às mudança do ambiente. A bactéria Pseudomonas aeruginosa é encontrada em diversos habitats, alguns com condições bastante desfavoráveis à sobrevivência e ao crescimento. Para adaptar-se à diferentes condições ambientais, P. aeruginosa possui um arsenal sofisticado de genes e regulons que controlam a expressão gênica. A baixa disponibilidade de fosfato solúvel no meio gera a expressão coordenada dos genes do regulon PHO, entre eles, o operon pst, que codifica um sistema de transporte de fosfato inorgânico (Pi) de alta afinidade. O último gene do operon pst codifica a proteína PhoU, que não participa do transporte de Pi, mas que, em conjunto com o sistema Pst, atua como repressora da expressão do regulon PHO quando há excesso desse nutriente no meio. P. aeruginosa também é um patógeno oportunista, que tem a capacidade de infectar uma ampla gama de organismos hospedeiros, de plantas a humanos. A promiscuidade patogênica dessa bactéria é devida a um repertório variado de genes de virulência em seu genoma. Nessa tese são descritos diversos aspectos relacionados aos efeitos fenotípicos do nocaute de phoU na cepa PA14 de P. aeruginosa. Entre eles, foi analisado o efeito da mutação phoU sobre a virulência em larvas de Galleria mellonella e a capacidade antibacteriana de nanopartículas de prata. Foram também estudados os efeitos da suplementação de ferro e magnésio no meio sobre o crescimento bacteriano e a atividade enzimática da fosfatase alcalina. O metaboloma do mutante phoU e da cepa selvagem cultivados em carência e suficiência de fosfato foi comparado. Além disso, isolados de um experimento de evolução em cultura contínua foram sequenciados e os fenótipos de virulência e sensibilidade à antibióticos foram avaliados. Os resultados mostram que a concentração de ferro interfere na taxa de crescimento e no rendimento do mutante phoU além de aumentar fortemente a atividade da fosfatase alcalina. Por outro lado, a suplementação de magnésio interfere no rendimento e na motilidade do tipo swarming. Além disso foi mostrado que o mutante phoU é muito menos virulento quando comparado com a cepa selvagem. Por último, foram identificados SNPs em alguns genes dos isolados do experimento de evolução no quimiostato. A virulência foi parcialmente restaurada nos isolados em comparação à cepa ancestral. Foram feitas tentativas no sentido de complementar as mutações com os genes selvagens correspondentes.
Title in English
Pseudomonas aeruginosa phoU mutant characterization.
Keywords in English
Pseudomonas aeruginosa
operon pst
PHO regulon
phosphate
Polyphosphate
ppGpp
Abstract in English
One of the most notable characteristics of microorganisms is their ability to adapt to environmental changes. Pseudomonas aeruginosa is found in several habitats, some with conditions quite unfavorable to survival and growth. To adapt to different environmental conditions, P. aeruginosa has a sophisticated arsenal of genes and regulons that control gene expression. Low availability of soluble phosphate in the media triggers the coordinate expression of the PHO regulon genes, among them, the pst operon, which encodes a high-affinity inorganic phosphate (Pi) transport system. The last pst operon gene encodes the PhoU protein, which does not participate in the Pi transport, but which, together with the Pst system, acts as a repressor of PHO regulon expression when there is an excess of that nutrient in the media. P. aeruginosa is also an opportunistic pathogen, which has the ability to infect a wide range of host organisms, from plants to humans. The pathogenic promiscuity of this bacteria is due to a varied repertoire of virulence genes in its genome. In this thesis several aspects related to the phenotypic effects of the phoU knockout in the PA14 strain of P. aeruginosa are described. Among them, the effect of phoU mutation on virulence in Galleria mellonella larvae and the antibacterial capacity of silver nanoparticles was analyzed. The effects of iron and magnesium supplementation in the media on bacterial growth and the enzymatic activity of alkaline phosphatase have also been studied. The phoU mutant and the wild-type strain metabolome cultivated in phosphate deficiency and sufficiency was compared. In addition, isolates from a continuous culture evolution experimente were sequenced and virulence and antibiotic susceptibility phenotypes were evaluated. The results show that the iron concentration affects the growth rate and yield of the phoU mutant in addition to strongly increasing alkaline phosphatase activity. On the other hand, magnesium supplementation interferes with swarming performance and motility. In addition, it has been shown that the phoU mutant is much less virulent when compared to the wild-type strain. Finally, SNPs were identified in some genes from the isolates from the chemostat evolution experiment. Virulence was partially restored in the isolates compared to the ancestral strain. Attempts have been made to complement the mutations with the corresponding wild-type genes.
 
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Publishing Date
2022-01-07
 
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