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Dissertação de Mestrado
DOI
https://doi.org/10.11606/D.42.2022.tde-07032023-163831
Documento
Autor
Nome completo
Andre Luiz de Araújo Silva
Unidade da USP
Área do Conhecimento
Data de Defesa
Imprenta
São Paulo, 2022
Orientador
Banca examinadora
Santos, Ethel Bayer (Presidente)
Alves, João Marcelo Pereira
Antunes, Luis Caetano Martha
Baldini, Regina Lúcia
Título em português
Caracterização de um novo grupo de efetores pertencente a superfamília NlpC/P60 secretados pelo T6SS de Salmonella spp.
Palavras-chave em português
Salmonella
competição bacteriana
efetores
sistema de secreção do tipo 6
toxinas
Resumo em português
Bactérias vivem em comunidades polimicrobianas e competem constantemente por recursos. Espécies Gram-negativas como Salmonella spp. codificam um sistema de secreção de proteínas do tipo VI (T6SS) que constitui um aparato contrátil formado por 13 proteínas capazes de injetar proteínas tóxicas (efetores) dentro de bactérias competidoras. O gênero Salmonella codifica cinco T6SSs filogeneticamente distintos em diferentes ilhas de patogenicidade: Salmonella enterica sorotipo Typhimurium codifica um T6SS na SPI-6 (Salmonella Pathogenicity Island-6); S. enterica sorotipo Gallinarum codifica um T6SS na SPI-19; S. arizonae codifica dois T6SS nas ilhas SPI-20 e SPI-21; e S. bongori codifica um T6SS na SPI-22. Estudos anteriores demonstraram a importância do T6SS de SPI-6 em S. Typhimurium e SPI-19 em S. Gallinarum para infecção de hospedeiros vertebrados; no entanto, até o momento foram descritos apenas quatro efetores secretados pelos T6SSs de Salmonella spp. A identificação de novos efetores secretados via T6SSs e a caracterização de seus mecanismos de ação permitirão entender a contribuição desses sistemas para a patogenicidade de Salmonella, a dinâmica das comunidades microbianas e manutenção de reservatórios ambientais deste patógeno, além de contribuir para descoberta de novos mecanismos antimicrobianos. Neste contexto, este trabalho tem como objetivo caracterizar um novo grupo de efetores do T6SS de Salmonella spp. que pertence à superfamília NlpC/P60 identificado utilizando abordagens computacionais durante análise de 10 mil genomas de Salmonella (10KSG). Tox241 é um membro representativo desse grupo, e apresenta toxicidade quando expressa no periplasma de Escherichia coli. Predições estruturais e docking molecular sugerem que Tox241 é uma fosfolipase. Esse trabalho contribui para o aumento do conhecimento sobre as armas utilizadas por bactérias em conflitos biológicos.
Título em inglês
Caracterização de um novo grupo de efetores pertencente a superfamília NlpC/P60 secretados pelo T6SS de Salmonella spp.
Palavras-chave em inglês
Salmonella
bacterial competition
effectors
toxins
type 6 secretion system
Resumo em inglês
Bacteria live in polymicrobial communities and constantly compete for resources. Gram-negative species such as Salmonella spp. encode a type VI protein secretion system (T6SS), which is a contractile apparatus formed by 13 proteins capable of injecting toxic proteins (effectors) into competing bacteria. The genus Salmonella encodes five phylogenetically distinct T6SSs in different pathogenicity islands: Salmonella enterica serotype Typhimurium encodes a T6SS in SPI-6 (Salmonella Pathogenicity Island-6); S. enterica serotype Gallinarum encodes a T6SS in SPI-19; S. arizonae encodes two T6SS on islands SPI-20 and SPI-21; and S. bongori encodes a T6SS in SPI-22. Previous studies have demonstrated the importance of the SPI-6 T6SS for S. Typhimurium and SPI-19 T6SS for S. Gallinarum during infection of vertebrate hosts; however, only four effectors secreted by the T6SSs of Salmonella spp. have been identified so far. The identification of new effectors secreted via T6SSs and the characterization of their mechanisms of action will allow us to understand the contribution of these systems to the pathogenicity of Salmonella, the dynamics of microbial communities and the maintenance of environmental reservoirs of this pathogen, in addition to contributing to the discovery of new antimicrobial mechanisms. Hence, this work aims to characterize a new group of T6SS effectors from Salmonella spp. belonging to the NlpC/P60 superfamily, which was identified using computational approaches during the analysis of 10K genomes of Salmonella (10KSG). Tox241 is a representative member of this group and is toxic when expressed in the periplasm of Escherichia coli. Structural predictions and molecular docking suggest Tox241 is a phospholipase. This work contributes with knowledge about the biochemical weapons used by bacteria in biological conflicts.
 
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Data de Liberação
2025-03-06
Data de Publicação
2023-03-09
 
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