Amostras de diferentes espécies de Phreatobius foram coletadas para obtenção de dados moleculares potencialmente informativos do gene nuclear RAG-2 para resolver as relações filogenéticas do gênero. Apresento resultados de sequências. Os dados de Phreatobius foram combinados com sequências equivalentes de representantes de várias outras famílias de Siluriformes, e analisados via máxima parcimônia (total de 966 pares de base de RAG-2 para 176 táxons). As análises resultaram em 172 árvores com 5213 passos. O resultado do consenso estrito indica fortemente que Phreatobius forma um grupo monofilético (sustentado por 33 sinapomorfias moleculares) com Pseudopimelodidae e Pimelodidae, e Conorhynchos + Heptapteridae. Hipóteses anteriores posicionando Phreatobius exclusivamente com Heptapteridae não foram sustentadas. Os resultados apresentados requerem que Phreatobius seja alocado na sua própria família, Phreatobiidae (disponível em nível subfamiliar). Uma revisão taxonômica de Phreatobiidae mostra que existem ao menos sete espécies, das quais apenas três descritas: Phreatobius cisternarum, Phreatobius dracunculus, Phreatobius sanguijuela, Phreatobius sp. "Anapixi", Phreatobius sp. "Jaú", Phreatobius sp. Tarumanzinho", Phreatobius sp. "Viruá". A hipótese de relações filogenéticas dentro de Phreatobiidae mostra que Phreatobius cisternarum é grupo-irmão do clado composto por (Phreatobius sp. "Viruá" (P. dracunculus + Phreatobius sp. "Tarumanzinho")). O mapeamento filogenético demonstra que o hábito subterrâneo evoluiu uma única vez na família e o ambiente freático foi invadido duas vezes.

Samples from different species of Phreatobius were collected in order to obtain molecular data from nuclear RAG-2 gene sequence potentially informative to resolve phylogenetic relationships of the genus. The data on Phreatobiidae were combined with equivalent sequence information from representatives of several other siluriform families, and analyzed by maximum parsimony (a total of 966 bp RAG-2 for 176 taxa). The analyses resulted in 172 trees, with 5213 steps. The strict consensus results strongly indicate that Phreatobius forms a monophyletic group (supported by 33 molecular synapomorphies) with Pseudopimelodidae, Pimelodidae, and Conorhynchos + Heptapteridae. Previous hypotheses aligning Phreatobius exclusively with Heptapteridae were not supported. Results herein presented requires that Phreatobius be allocated in its own family, as Phreatobiidae (already available at subfamilial level). A taxonomic revision of Phreatobiidae shows that at least seven species exist, only three of which currently described: Phreatobius cisternarum, Phreatobius dracunculus, Phreatobius sanguijuela, Phreatobius sp. "Anapixi", Phreatobius sp. "Jaú", Phreatobius sp. Tarumanzinho", Phreatobius sp. "Viruá". A hypothesis of relationships within Phreatobiidae shows that P. cisternarum is sister-group of a clade composed of (P. sp. "Viruá" (P. dracunculus + P. sp. "Tarumanzinho")). Phylogenetic mapping shows that subterranean habit has evolved once in the family and the phreatic environment was invaded twice.