• JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
 
  Bookmark and Share
 
 
Mémoire de Maîtrise
DOI
https://doi.org/10.11606/D.3.2023.tde-26102023-100339
Document
Auteur
Nom complet
Leonardo Toshinobu Kimura
Adresse Mail
Unité de l'USP
Domain de Connaissance
Date de Soutenance
Editeur
São Paulo, 2023
Directeur
Jury
Simplicio Junior, Marcos Antonio (Président)
Henriques, Marco Aurélio Amaral
Miers, Charles Christian
Titre en portugais
Amazon Biobank: um banco de dados genético baseado em blockchain para bioeconomia.
Mots-clés en portugais
Banco de dados genético
Biotecnologia
Computadores (Segurança)
Sistemas distribuídos
Resumé en portugais
A bioeconomia é proposta como uma alternativa sustentável para o desenvolvimento econômico de regiões de alta biodiversidade. Especialmente no campo da genômica, o desenvolvimento de sequenciamento genético de baixo custo abre uma oportunidade para novos atores além da academia de se envolverem na atividade. No entanto, os repositórios genômicos existentes sofrem com a falta de rastreabilidade de dados e mecanismos econômicos de compartilhamento de benefícios, resultando em menor motivação para os provedores de dados. Para enfrentar esse desafio, é apresentado Amazon Biobank, um banco de dados genético comunitário. Ao usar as tecnologias blockchain e peer-to-peer (P2P), é permitido o compartilhamento de dados distribuído e transparente, enquanto os smart contracts garantem o compartilhamento justo de benefícios entre todos os participantes do sistema. Além disso, o Amazon Biobank foi projetado para ser auditável por qualquer usuário, reduzindo a necessidade de administradores confiáveis do sistema. Para validar essa abordagem, foi implementado um protótipo usando Hyperledger Fabric e BitTorrent e avaliamos seu desempenho. Os resultados mostram que o protótipo pode suportar pelo menos 400 transações por segundo em uma pequena rede e que isso pode ser melhorado adicionando novos nós ou alocando recursos computacionais adicionais. Assim, é esperado que o Amazon Biobank sirva como uma ferramenta vital para a pesquisa biotecnológica colaborativa, promovendo o desenvolvimento sustentável em regiões de alta biodiversidade.
Titre en anglais
Amazon Biobank: a blockchain-based genomic database for bioeconomyi.
Mots-clés en anglais
Benefit-sharing
Biodiversity
Blockchain
DNA database
DNA sequencing
Smart contract
Sustainable development
Resumé en anglais
Bioeconomy is proposed as a sustainable alternative for the economic development of high-biodiversity regions. Especially in the field of biodiversity genomics, the development of low-cost DNA sequencing opens an opportunity for new actors beyond academia to engage in genomic sequencing. However, existing genomic repositories suffer from a lack of data traceability and economic benefit-sharing mechanisms, resulting in limited motivation for data providers to contribute. To address this challenge, we present Amazon Biobank, a community-driven genetic database. By leveraging blockchain and peer-to-peer (P2P) technologies, we enable distributed and transparent data sharing, while smart contracts ensure fair benefit-sharing among all system participants. In addition, Amazon Biobank is designed to be auditable by any user, reducing the need for trusted system managers. To validate our approach, we implemented a prototype using Hyperledger Fabric and BitTorrent and evaluate its performance. Our results show that the prototype can support at least 400 transactions per second in a small network and that it can be further improved by adding new nodes or allocating additional computational resources. We expect that Amazon Biobank will serve as a vital tool for collaborative biotechnology research, fostering sustainable development in high-biodiversity regions.
 
AVERTISSEMENT - Regarde ce document est soumise à votre acceptation des conditions d'utilisation suivantes:
Ce document est uniquement à des fins privées pour la recherche et l'enseignement. Reproduction à des fins commerciales est interdite. Cette droits couvrent l'ensemble des données sur ce document ainsi que son contenu. Toute utilisation ou de copie de ce document, en totalité ou en partie, doit inclure le nom de l'auteur.
Date de Publication
2023-10-27
 
AVERTISSEMENT: Apprenez ce que sont des œvres dérivées cliquant ici.
Tous droits de la thèse/dissertation appartiennent aux auteurs
CeTI-SC/STI
Bibliothèque Numérique de Thèses et Mémoires de l'USP. Copyright © 2001-2024. Tous droits réservés.