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Dissertação de Mestrado
DOI
https://doi.org/10.11606/D.23.2023.tde-26062023-083722
Documento
Autor
Nome completo
Rafael Antônio Velôso Caixeta
E-mail
Unidade da USP
Área do Conhecimento
Data de Defesa
Imprenta
São Paulo, 2023
Orientador
Banca examinadora
Silva, Paulo Henrique Braz da (Presidente)
Hiraki, Karen Renata Nakamura
Pallos, Débora
Schussel, Juliana Lucena
Título em português
Excreção oral de TorqueTeno vírus (TTV) em pacientes internados por complicações da COVID-19
Palavras-chave em português
Biomarcadores
COVID-19
Saliva
SARS-CoV-2
TorqueTeno Vírus
Resumo em português
O TorqueTeno virus (TTV) é um pequeno vírus de DNA constituinte do viroma humano e considerado não patogênico. Altos níveis de TTV tem apresentado uma correlação clara, consistente e direta com a intensidade de imunossupressão individual induzida ou não e com distúrbios crônicos de natureza inflamatória. Devido a natureza inflamatória da COVID-19, acredita-se que a replicação do TTV esteja acontecendo nestes casos, aumentando os seus níveis detectáveis e refletindo o status imunológico do paciente, podendo atuar como biomarcador de severidade. O objetivo do presente trabalho foi avaliar a carga viral salivar de TTV em pacientes diagnosticados com COVID-19 e hospitalizados por suas complicações visando buscar a associação com o grau de severidade da doença (casos moderados e graves) e desfecho (alta ou óbito). Amostras de saliva foram coletadas de 176 pacientes hospitalizados por complicações da COVID-19, todos diagnosticados por RT-PCR em amostras de swab nasofaríngeo (88 casos graves e 88 moderados), nas quais investigou-se a presença de SARS-CoV-2 e TTV por meio de qPCR. Parâmetros clínicos de gravidade da COVID-19, dados demográficos, assim como desfecho, foram coletados dos prontuários médicos. Para as análises estatísticas foi utilizado o software SPSS version 20.0. Foi aplicado teste normalidade Shapiro-Wilk, encontrando distribuição normal para idade e anormal para o quantitativo de TTV, assim foi utilizado teste T de student para avaliar idade e gravidade da COVID-19 e Mann-Whitney para quantitativo do TTV com desfecho e gravidade. Para avaliar as variáveis categóricas com positividade do TTV e gravidade foi utilizado Teste Qui-Quadrado de Pearson ou Exato de Fisher. Todos os testes foram realizados com nível de significância de 5%. A maioria dos pacientes era do sexo masculino, sendo que estes apresentavam majoritariamente quadros graves. Pacientes com quadro grave apresentaram associação estatisticamente significante com as variáveis que denotam maior gravidade da doença (p<0.001) e maior número de óbitos (p=0.003) comparados aos com quadro moderado. Foi observada a presença de SARS-CoV-2 na saliva de 64.77% pacientes e TTV em 55.68%. Pacientes com piores cenários clínicos (p<0.001) e que evoluíram para óbito (p=0.003) apresentaram maior prevalência na detecção de TTV. A média de carga viral em cópias/mL dos pacientes com quadro grave foi de 7.32 log 10, com quadro moderado de 7.66 log 10, pacientes que receberam alta de 6.85 log 10 e que evoluíram para óbito de 9.35 log 10. Foi encontrada associação estatisticamente significante da distribuição da carga salivar de TTV com a classificação da gravidade da COVID-19 (p=0.004) e desfecho (p<0.001). A detecção salivar de TTV pode ser útil como biomarcador de severidade e prognóstico da COVID-19.
Título em inglês
Oral shedding of torque-teno vírus (TTV) in patients hospitalised due to COVID-19 complications
Palavras-chave em inglês
Biomarkers
COVID-19
Saliva
SARS-CoV-2
Torque-teno virus
Resumo em inglês
Torque-teno virus (TTV) is a small DNA virus constituting the human virome and is considered to be non-pathogenic. High levels of TTV has been shown to have a clear, direct, consistent correlation with the intensity of individual immunosuppression, either induced or non-induced, as well as with inflammatory chronic disorders. Due to the inflammatory nature of COVID-19, it is believed that TTV replication occurs in such cases as its detectable levels are increased, which reflects the patients immunological status and thus can be used as a biomarker of severity. The objective of the present study was to assess the salivary viral load in patients diagnosed with COVID-19 who were hospitalised due to complications and then find an association with disease severity (i.e. moderate to severe cases) and outcome (i.e. discharge or death). Saliva samples were collected from 176 patients hospitalised due to COVID-19 complications, all diagnosed by using RT-PCR on nasopharyngeal swabs (88 severe cases and 88 moderate cases), in which the presence of SARS-CoV-2 and TTV was investigated by means of qPCR. Clinical parameters of COVID-19 severity, demographic data and outcome were obtained from the patients medical records. SPSS software version 20.0 was used for statistical analyses. Shapiro-Wilk normality test was applied to the data, showing a normal distribution for age and a non-normal one for TTV quantification. For this reason, Students t-test was used to assess age and COVID-19 severity, whereas Mann-Whitneys test was used to assess TTV quantification in relation to outcome and COVD-19 severity. Pearsons chi-square test or Fishers exact test was used to assess categorical variables in relation to TTV positivity and COVID-19 severity. All statistical tests were performed at a significance level of 5%. The majority of the patients were male and mostly with a severe condition. A statistically significant association with variables indicating greater severity (P < 0.001) and higher number of deaths (P = 0.003) was found in patients with severe condition compared to those with moderate condition. Presence of SARS-CoV-2 in the saliva of 64.77% of the patients and of TTV in 55.68% of them was also observed. Patients with impaired clinical conditions (P < 0.001), which evolved to death (P = 0.003), showed higher prevalence of TTV detection. The mean viral load (copies/mL) in patients with severe condition was 7.32 log10, in which those being discharged and those evolving to death had values of 6.85 log10 and 9.35 log10, respectively. A statistically significant association was found in the distribution of TTV viral load in saliva with severity of COVID-19 (P = 0.004) and outcome (P < 0.001). Detection of TTV in saliva can be useful as a biomarker of severity and prognosis of COVID-19.
 
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Data de Publicação
2023-07-03
 
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