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Doctoral Thesis
DOI
https://doi.org/10.11606/T.17.2023.tde-11042023-093527
Document
Author
Full name
Luiz Fernando Bazzo Catto
Institute/School/College
Knowledge Area
Date of Defense
Published
Ribeirão Preto, 2022
Supervisor
Committee
Rodrigues, Rodrigo do Tocantins Calado de Saloma (President)
Rego, Eduardo Magalhães
Valera, Elvis Terci
Velloso, Elvira Deolinda Rodrigues Pereira
Title in Portuguese
A expressão do TERRA é desregulada na leucemia mieloide aguda
Keywords in Portuguese
Leucemia mieloide aguda
R-loops
Telomerase
Telômeros
TERRA
Abstract in Portuguese
Os telômeros compõem as extremidades dos cromossomos lineares e são responsáveis por manter a integralidade genômica. As regiões subtelomérica e teloméricas são transcritas em RNAs longo não codificantes denominados TERRA (TElomeric Repeat containing RNA). Os TERRAs formam híbridos de DNA-RNA denominados R-loops e estão envolvidos na manutenção e estabilização do telômero, alongamento telomérico por vias dependentes e independentes da telomerase e controle transcricional. Os R-loops devem ser mantidos em níveis ideais, tanto alto quanto baixos níveis de R-loops estão relacionados a lesão do DNA e encurtamento telomérico. Este estudo teve como objetivo avaliar a expressão de TERRA em leucemias mieloides agudas (LMAs). Também foram avaliadas as expressões de genes relacionados a dinâmica telomérica (TERT, TRF2), controle dos R-loops (RNaseH1, RNaseH2) e dinâmica da transcrição dos TERRAs (TRF2, ATRX). A análise por clusterização hierárquica baseada na expressão de TERRA demonstrou que existem dois grupos de LMA, um com alta expressão de TERRA e outro com baixa expressão de TERRA. Ambos os grupos apresentam comprimento telomérico curto, alta expressão de TRF2, RNaseH1 e ATRX. O grupo com alta expressão de TERRA apresenta menor expressão de RNaseH2 (p < 0,05), enzima essencial para a diminuição dos R-loops durante a fase S, e de TERT (p < 0,05). Neste grupo, a baixa expressão de RNaseH2 pode favorecer o acúmulo de R-loops, aumento da quebra de DNA e a ativação de vias alternativas de alongamento telomérico independente da telomerase. Em relação a caracterização citogenética molecular dos grupos de LMAs, o grupo com alta expressão de TERRA se caracteriza por uma baixa prevalência de mutações em fatores de splicing. Baseado na prevalência dos diferentes subtipos de LMA da nossa coorte, foram selecionadas duas linhagens celulares, NB4, uma linhagem de leucemia promielocítica aguda, e THP1, uma linhagem de leucemia mielomonocítica a fim de estudar a importância dos R-loops na manutenção dessas linhagens. As linhagens foram transduzidas com vetores lentivirais contendo RNaseH1-GFP ou apenas GFP. As linhagens transduzidas com vetor lentiviral RNaseH1-GFP apresentaram alta expressão de RNaseH1 (p < 0,05) e maior quimiossensibilidade a citarabina (p < 0,05) . Este resultado indica que a inibição dos R-loops é um potencial alvo terapêutica nas LMAs.
Title in English
TERRA expression is dysregulated in acute myeloid leukemia
Keywords in English
Acute myeloid leukemia
R-loops
Telomerase
Telomere
TERRA
Abstract in English
Telomeres compose the ends of linear chromosomes and maintain genomic integrity. The subtelomeric and telomeric regions are transcribed into long non-coding RNAs called TERRA (TElomeric Repeat containing RNA). TERRAs form DNA-RNA hybrids called R-loops and are involved in telomere maintenance and stabilization, telomeric elongation by telomerasedependent and independent pathways, and transcriptional control. R-loops must be maintained at optimal levels. Both high and low levels of R-loops are related to DNA damage and telomeric shortening. This study aimed to evaluate the expression of TERRA in acute myeloid leukemias (AMLs). The expressions of genes related to telomeric dynamics (TERT, TRF2), R-loops control (RNaseH1, RNaseH2), and TERRA transcriptional dynamics (TRF2, ATRX) were also evaluated. The analysis by hierarchical clustering based on the expression of TERRA revealed two groups of AML, one with high TERRA expression and the other with low TERRA expression. Both groups demonstrated short telomeric length and high expression of TRF2, RNaseH1, and ATRX. The group with high expression of TERRA showed lower expression of RNaseH2 (p < 0.05), an enzyme responsible for the reduction of R-loops during the S phase, and of TERT (p < 0.05). In this group, the low expression of RNaseH2 may favor the accumulation of R-loops, increased DNA breakage, and activation of alternative telomere lengthening. Regarding the molecular cytogenetic characterization of the AML groups, the group with high expression of TERRA is characterized by a low prevalence of mutations in splicing factors. Based on the prevalence of different AML subtypes in our cohort, two cell lines, NB4, an acute promyelocytic leukemia lineage, and THP1, a myelomonocytic leukemia lineage, were selected to study the importance of R-loops in the maintenance of these lines. NB4 and THP1 were transduced with lentiviral vectors containing RNaseH1-GFP or GFP alone. Cell lines transduced with the lentiviral vector RNaseH1-GFP showed high expression of RNaseH1 (p < 0.05) and greater chemosensitivity to cytarabine (p < 0.05). This result indicates that inhibition of R-loops is a potential therapeutic target in AMLs.
 
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Publishing Date
2023-04-12
 
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