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Dissertação de Mestrado
DOI
https://doi.org/10.11606/D.17.2021.tde-09092021-133246
Documento
Autor
Nome completo
Yasmin de Araujo Ribeiro
Unidade da USP
Área do Conhecimento
Data de Defesa
Imprenta
Ribeirão Preto, 2021
Orientador
Banca examinadora
Pereira, Tiago Campos (Presidente)
Rodriguez, Monica Bucciarelli
Silva, Luis Lamberti Pinto da
Título em português
Análises in silico de DAF-2 e exposição de Panagrolaimus superbus em câmara anóxica de nitrogênio (N2)
Palavras-chave em português
Ametabolismo
Anidrobiose
Anóxia
P. superbus
Resumo em português
A anidrobiose, termo derivado do grego "vida sem água", é um curioso estado de animação suspensa no qual determinados organismos adentram em resposta a dessecação extrema. Atualmente, organismos representantes de todos os reinos já foram identificados com essa capacidade, incluindo o nematoide utilizado neste estudo, Panagrolaimus superbus. O estado anidrobiótico permite a tolerância a uma grande diversidade de estresses físicos como extremos de temperatura, hiperaceleração e imersão em gálio. Devido as interessantes propriedades que a anidrobiose confere aos organismos, a melhor compreensão desse fenômeno tem despertado o interesse da comunidade científica. Nesse sentido, uma questão central é a caracterização do estado ametabólico, ainda pouco aceito pela comunidade científica. Paralelamente, o gene daf-2 codifica uma proteína que direciona o desenvolvimento do nematoide Caenorhabditis elegans, sendo sua atuação essencial para a anidrobiose. Considerando o contexto, o presente estudo objetiva contribuir para melhor definição do metabolismo de organismos anidrobiontes e investigar a proteína codificada por daf-2 em busca de possíveis assinaturas moleculares da anidrobiose. Dessa forma, o organismo anidrobionte P. superbus foi mantido por um, três, e seis meses em câmara anóxica e analisamos in silico (e.g., composição, modelagem estrutural, análise e alinhamento de estruturas primárias e terciárias) a proteína DAF-2 em organismos anidrobiontes e não-anidrobiontes. Os resultados encontrados sugerem que a proteína de organismos anidrobiontes é significantemente mais básica, embora não apresente divergências em suas estruturas terciárias. Demonstramos também que a exposição de P. superbus dessecados em câmara anóxica de N2 por um, três, e seis meses, não impacta negativamente em sua viabilidade, quando comparada com seus respectivos grupos controles. Portanto, nós somamos novas evidências a hipótese de ametabolismo durante a anidrobiose e pontuamos a característica de basicidade como algo de importância para este interessante estado.
Título em inglês
In silico analysis of DAF-2 and exposure of Panagrolaimus superbus in anoxic nitrogen (N2) chamber
Palavras-chave em inglês
Ametabolism
Anhydrobiosis
Anoxia
P. superbus
Resumo em inglês
Anhydrobiosis, a term derived from the Greek "life without water", is a curious state of suspended animation into which certain organisms enter in response to extreme desiccation. Currently, organisms representing all kingdoms have already been identified with this ability, including the nematode used in this study, Panagrolaimus superbus. The anhydrobiotic state allows tolerance to a wide variety of physical stresses such as temperature extremes, hyperacceleration, and immersion in gallium. Due to the interesting properties that anhydrobiosis gives to organisms, a better understanding of this phenomenon has aroused the interest of the scientific community. In this sense, a central issue is the characterization of the ametabolic state, still little accepted by the scientific community. In parallel, the daf-2 gene encodes a protein that directs the development of the nematode Caenorhabditis elegans, its role being essential for anhydrobiosis. Considering the context, this study aims to contribute to a better definition of the metabolism of anhydrobiotic organisms and to investigate the protein encoded by daf-2 in search of possible anhydrobiosis-related molecular signatures. Thus, the anhydrobiont organism P. superbus was kept for one, three, and six months in an anoxic chamber, and we in silico analyzed (e.g., composition, structural modeling, analysis, and alignment of primary and tertiary structures) the DAF-2 protein in anhydrobiont organisms and non-anhydrobionts. The results found suggest that the protein of anhydrobiont organisms is significantly more basic, although it does not present divergences in its tertiary structures. We also demonstrated that the exposure of P. superbus desiccated in an anoxic N2 chamber for one, three, and six months, does not negatively impact its viability, when compared to their respective control group. Therefore, we add new evidence to the hypothesis of ametabolism during anhydrobiosis and we point out the basicity characteristic as something of importance for this interesting state.
 
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Data de Publicação
2021-10-06
 
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