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Tese de Doutorado
DOI
https://doi.org/10.11606/T.17.2023.tde-08082023-145223
Documento
Autor
Nome completo
Joelma de Oliveira Cruz
Unidade da USP
Área do Conhecimento
Data de Defesa
Imprenta
Ribeirão Preto, 2023
Orientador
Banca examinadora
Goldman, Maria Helena de Souza (Presidente)
Hartfelder, Klaus Hartmann
Silva, Luis Lamberti Pinto da
Vincentz, Michel Georges Albert
Título em inglês
SCI1 expression and its transcriptional regulation in the floral meristem and flowers of Nicotiana tabacum
Palavras-chave em inglês
Cell proliferation
Floral development
Floral meristem
Meristematic cells
Transcriptional regulation
Resumo em inglês
The reproduction of angiosperms is strictly regulated by genetic pathways and environmental signals that result in the transition from the vegetative to the reproductive phase. The reproductive phase is marked by the floral meristem that results in the flower, a highly modified branch formed by the four floral whorls: sepals, petals, stamens, and pistil. The stamens and the pistil are responsible for producing male and female gametes, therefore, are of great importance in reproduction. Understanding the development of these whorls involves understanding the molecular mechanisms that guarantee correct development. To better understand the development of the pistil, our research group carried out the initial characterization of a gene that was preferentially expressed in the pistil of the Nicotiana tabacum flower and controls proliferation in this organ. This was named SCI1 (Stigma/style Cell-cycle Inhibitor 1). The mechanism of action of SCI1 has not yet been elucidated, and advances in investigations have revealed an extensive network of proteins with which SCI1 interacts. The SCI1 interactome allowed us to assume its involvement in RNA processing and cell cycle, basic processes for cell maintenance. The involvement of SCI1 in these processes allowed us to raise the hypothesis that SCI1 could express itself in other floral whorls and start to express itself in the initial stages of floral development. Therefore, this work aimed to determine where and when the SCI1 gene starts its expression in N. tabacum flowers, relate SCI1 expression to pistil development and analyze the expression of SCI1 in the ovaries analyze the transcriptional regulation of SCI1. To analyze SCI1 expression, in situ hybridization was used. It was observed that SCI1 starts its expression in the floral meristem and remains intensely expressed in the beginnings of floral whorls. Expression of SCI1 in floral meristem and whorl primordia indicates its involvement in the development of all floral whorls. As the whorls are specified, the expression of SCI1 is reduced, except in the pistil, the organ in which the last meristematic cells of the flower are located. SCI1 mRNA was detected both in non-fused and already fused carpels. SCI1 is also detected in the young ovary when the placenta is expanding. It is later detected in the primordia of ovules and ovules with their structures, integument funiculus, and nucellus established. In these structures, SCI1 was detected in the funiculus and integument. In situ hybridization also revealed co-expression of SCI1 with the NAG1, NtANT, and NtWUS genes. SCI1 co-expressed with NtWUS and NAG1 in the floral meristem. NtWUS encodes a Homeobox transcription factor that regulates the proliferation of pluripotent cells in the floral meristem, and NAG1 encodes a transcription factor responsible for the specification of the third and fourth floral whorls and the termination of meristematic cells. In stamens and carpels, SCI1 is co-expressed with NAG1 and NtANT. SCI1 co-expresses with NtANT in ovule primordia, integument, and funiculus. NtANT encodes a transcription factor with the AP2 domain that positively regulates cell proliferation from the beginning of floral development and acts on the correct development of the pistil and ovules. The co-expression of SCI1 with the transcription factors NtWUS, NAG1, and NtANT, added to the function described for SCI1, which involves controlling cell proliferation and controlling stigma and style development, reveals a possible regulation of SCI1 by these transcription factors. These transcription factors interactions with cis-elements in the SCI1 promoter were predicted in silico and confirmed in monohybrid assays (Yeast One Hybrid) with the portion of the SCI1 promoter, called Frag1, which comprises 443pb above the initiation codon (ATG). Interactions were also confirmed via EMSA. With luciferase assay, it was possible to determine what effect the interaction of these transcription factors has on SCI1 expression. Transcription factors NAG1 and NtANT promote activation of SCI1 expression by binding to their respective cis-elements. While the interaction of NtWUS was demonstrated to reduce the expression of SCI1, how results were not expressive. The involvement of auxin in the regulation of SCI1 was also predicted. It was demonstrated by the luciferase assay that the synthetic phytohormone NAA significantly increases the expression of SCI1 when regulated by NtANT. The IIA phytohormone positively influenced SCI1 expression when regulated by NtANT. The endogenous expression of the SCI1 protein was obtained through transgenic plants expressing the SCI1 protein in translational fusion to GFP under the control of its endogenous promoter. Thus, it was possible to determine the protein's location in the flower. Like mRNA, the SCI1 protein is detected from the floral meristem and in all young whorls. A centripetal protein reduction was observed as the whorls developed, but this reduction was not observed in the pistil until stage 2. Due to the size of the flower, observations at more advanced stages were impossible. It was also possible to observe the SCI1 protein in specialized tissues of the stigma and style, transmitting tissue of the style and secretory zone of the stigma and in the parenchyma. In the ovaries, the SCI1 protein was detected in the placenta and the ovules in their integument and funiculus. With these plants, it was possible to confirm the location of SCI1 in the nucleus and nucleolus. The data set confirms the hypothesis that SCI1 begins to express itself in the floral meristem. Furthermore, the data also point to the expression of SCI1 in meristematic cells. Regulation of SCI1 by NtWUS reinforces its relationship with meristematic cells in the floral meristem. While the presence of SCI1 in the pistil and its regulation by the transcription factors NAG1 and NtANT reinforce the involvement of SCI1 in the proliferation of meristematic cells still present in these organs.
Título em português
Expressão de SCI1 e sua regulação transcricional no meristema floral e nas flores de Nicotiana tabacum
Palavras-chave em português
Células meristemáticas
Desenvolvimento floral
Meristema floral
Proliferação celular
Regulação transcricional
Resumo em português
A reprodução das angiospermas é um processo estritamente regulado por vias genéticas e sinais ambientais que resultam na transição da fase vegetativa para fase reprodutiva. A fase reprodutiva é marcada pela presença do meristema floral que resulta na flor, um ramo altamente modificado formado pelos quatro verticilos florais: sépalas, pétalas, estames e pistilo. Os estames e o pistilo são os responsáveis pela produção dos gametas, masculino e femininos, respectivamente e por isso, de grande importância na reprodução. Entender o desenvolvimento desses verticilos passa por compreender os mecanismos moleculares envolvidos que garantem o correto desenvolvimento. Para melhor compreender o desenvolvimento do pistilo, em nosso grupo de pesquisa foi realizada a caracterização inicial de um gene que se mostrou preferencialmente expresso no pistilo da flor de Nicotiana tabacum e controla a proliferação nesse órgão. Este, foi denominado SCI1 (Stigma/style Cell-cycle Inhibitor 1). O mecanismo de ação de SCI1 ainda não foi elucidado e os avanços nas investigações tem revelado uma extensa rede de proteína com quais SCI1 interage. O interactoma de SCI1 permitiu assumir seu envolvimento no processamento de RNA e ciclo celular, processos básicos para a manutenção da célula. O envolvimento de SCI1 nesses processos permitiu levantar a hipótese de que SCI1 poderia se expressar em outros verticilos florais e começaria a se expressar em momentos iniciais do desenvolvimento floral. Portanto, este trabalho teve por objetivos determinar onde e quando o gene SCI1 inicia sua expressão em flores de N. tabacum; relacionar a expressão de SCI1 com o desenvolvimento do pistilo; analisar a expressão de SCI1 nos ovários e analisar a regulação transcricional de SCI1. Para analisar a expressão de SCI1 foi utilizada a hibridização in situ. Foi observado que SCI1 inicia sua expressão no meristema floral e mantem-se expresso de forma intensa nos primórdios dos verticilos florais. A expressão de SCI1 no meristema floral e primórdios dos verticilos indica seu envolvimento no desenvolvimento de todos os verticilos florais. À medida que os verticilos se especificam, a expressão de SCI1 é reduzida, exceto no pistilo, órgão em que se localizam as últimas células meristemáticas da flor. O mRNA de SCI1 foi detectado tanto nos carpelos não fusionados, quanto já fusionados. SCI1 também foi detectado no ovário jovem quando a placenta está em expansão e posteriormente detectado nos primórdios dos óvulos e óvulos com suas estruturas, funículos integumento e nucelo, já estabelecidos. Nessa estruturas, SCI1 foi detectado no funículo e integumento. A hibridização in situ também revelou a co-expressão de SCI1 com os genes NAG1, NtAINTEGUMENTA (NtANT) e NtWUSCHEL (NtWUS). SCI1 co-expressa com NtWUS e NAG1 no meristema floral. NtWUS codifica um fator de transcrição Homeobox que regula a proliferação de células pluripotentes no meristema floral e NAG1 codifica um fator de transcrição responsável pela especificação do terceiro e quarto verticilos florais e pela terminação das células meristemáticas. Nos estames e carpelos SCI1 co-expressa com NAG1 e NtANT. SCI1 co-expressa com NtANT nos primórdios dos óvulos, no integumento e funículo. NtANT codifica um fator de transcrição com domínio AP2 que regula positivamente a proliferação celular desde o início do desenvolvimento floral e atua no correto desenvolvimento do pistilo e óvulos. A co-expressão de SCI1 com os fatores de transcrição NtWUS, NAG1 e NtANT, adicionada à função descrita para SCI1 que envolve da controle da proliferação celular e controle do desenvolvimento do estigma e estilete revela uma possível regulação de SCI1 por esses fatores de transcrição. As interações desses fatores de transcrição a cis-elementos presentes no promotor de SCI1 foram preditas in silico e confirmadas em ensaios de mono híbrido (Yeast One Hybrid) com a porção do promotor de SCI1, denominada Frag1, que compreende 443pb acima do códon de iniciação (ATG). As interações também foram confirmadas através do EMSA. Com ensaio de luciferase foi possível determinar qual efeito a interação desses fatores de transcrição tem sobre a expressão de SCI1. Os fatores de transcrição NAG1 e NtANT promovem a ativação da expressão de SCI1 ao de ligarem aos seus respectivos cis-elemento. Enquanto a interação de NtWUS demonstrou reduzir a expressão de SCI1, porém os resultados não foram expressivos. Também foi predito o envolvimento da auxina na regulação de SCI1. Foi demonstrado pelo ensaio de luciferase que o fitohormônio sintético ANA aumenta significativamente a expressão de SCI1 quando regulado por NtANT. Já o fitohormônio AIA apresentou influência positiva sobre a expressão de SCI1 quando regulado por NtANT. A expressão endógena da proteína SCI1 foi obtida através de plantas transgênicas expressando a proteína SCI1 em fusão traducional a GFP sob controle de seu promotor endógeno. Assim foi possível determinar a localização da proteína na flor. Como o mRNA, a proteína SCI1 é detectada desde o meristema floral e em todos os verticilos jovens. Foi observada redução da proteína de forma centrípeta à medida que os verticilos se desenvolviam, porém essa redução não foi observada no pistilo até o estádio 2. Devido ao tamanho da flor, não foram possíveis observações em estádios mais avançado. Com essas plantas também foi possível observar a proteína SCI1 nos tecidos especializados do estigma e estilete, tecido transmissor do estilete e zona secretória do estigma, assim como também no parênquima. Nos ovários, a proteína SCI1 foi detectada na placenta e nos óvulos, em seu integumento e funículo. Com essas plantas foi possível confirmar a localização de SCI1 no núcleo e nucléolo. O conjunto de dados obtidos confirmam a hipótese e de SCI1 começa a se expressar no meristema floral. Além do mais os dados ainda apontam a expressão de SCI1 em células meristemáticas. A regulação de SCI1 por NtWUS reforça a sua relação com células meristemáticas no meristema floral. Enquanto a presença de SCI1 no pistilo e sua regulação pelos fatores de transcrição NAG1 e NtANT reforçam o envolvimento de SCI1 na proliferação de células meristemáticas ainda presentes nesses órgãos.
 
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Data de Publicação
2023-08-24
 
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