Meduloblastoma (MB) é o tumor cerebral maligno mais frequente em crianças e adolescentes, sendo classificados em 4 subgrupos moleculares principais: WNT, SHH, Grupo 3 e Grupo 4. Pacientes do Grupo 3 (G3) apresentam o pior prognóstico dentre os subgrupos moleculares de MB, poucas terapias alvo já foram descritas como eficazes contra esse tipo de tumor. Dessa forma, análises que identifiquem genes diferencialmente expressos entre os subgrupos podem contribuir com a identificação de novos alvos terapêuticos. O VRK1 foi identificado como um desses potenciais alvos, apresentando-se hiperregulado em MB-G3, além de ser descrito como biomarcador de pior prognóstico e um alvo terapêutico promissor em vários tipos de câncer. Foi investigado in sílico e in vitro o efeito funcional de VRK1 na progressão tumoral de MB-G3. Primeiramente, foram utilizados quatro bancos de dados públicos de MBs pediátricos, disponível na plataforma R2: Genomics Analysis and Visualization Platform. Em seguida, foi realizada a correlação dos níveis de expressão de VRK1 com características clínicas de pacientes, cerebelo normal e sobrevida global e subgrupos moleculares. As análises semelhantes foram realizadas na coorte do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto e do Centro Infantil Boldrini (HC-FMRP/CIB). Através da plataforma Enrichr, foram realizadas in sílico, análises de enriquecimento de vias com os genes correlacionados. In vitro, após inibição de VRK1 por shRNA nas linhagens USP-13 e D283-Med, foram realizados ensaios funcionais. As análises estatísticas foram realizadas no software SPSS e GraphPad Prism. Resultados: Os resultados observados foram, pacientes com maior expressão de VRK1 estão associados a casos de metástase, desfecho clínico desfavorável e menor taxa de sobrevida global (p<0,05). A expressão gênica de VRK1 está significativamente inferior em amostras de cerebelo normal quando comparados às amostras tumorais (MB) (p<0,05). Foram encontrados genes correlacionados com VRK1 (|R| ≥ 0,3) enriquecidos em vias de regulação do ciclo celular, e nas vias mTOR, MAP, AMPK e p53 (p<0,05). Dentre os subgrupos moleculares de MB, sua expressão foi maior no subgrupo G3 quando comparados a SHH, assim como nas linhagens classificadas com grupo 3/4 (p<0,0001). In vitro, o silenciamento gênico de VRK1 impactou na proliferação celular, formação de colônias, migração e invasão celular em ambas as linhagens (p<0,0001). Conclusão: Observamos que VRK1 estar hiperexpresso em características desfavoráveis e em subgrupo de pior prognóstico, MB-G3. Os genes correlacionados estão influenciando em mecanismos celulares e vias importantes para a progressão tumoral de MB. Sendo que a depleção de VRK1 suprimiu os mecanismos, proliferativos, migratórios e invasivos. Sugerimos que VRK1 influencia a progressão tumoral em MB-G3, sendo um alvo terapêutico promissor para este tumor.

Medulloblastoma (MB) is the most common malignant brain tumor in children and adolescents, classified into four main molecular subgroups: WNT, SHH, Group 3, and Group 4. Patients in Group 3 (G3) exhibit the worst prognosis among the molecular subgroups of MB, and few targeted therapies have been described as effective against this type of tumor. Therefore, analyses identifying differentially expressed genes between subgroups can contribute to the identification of new therapeutic targets. VRK1 has been identified as one such potential target, being upregulated in MB-G3 and described as a biomarker for worse prognosis and a promising therapeutic target in various cancer types. The functional effect of VRK1 on the tumoral progression of MB-G3 was investigated in silico and in vitro. Initially, four public databases of pediatric MBs available on the R2: Genomics Analysis and Visualization Platform were used. Subsequently, the correlation of VRK1 expression levels with clinical characteristics of patients, normal cerebellum, overall survival, and molecular subgroups was performed. Similar analyses were conducted in the cohort of the Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto and the Centro Infantil Boldrini (HC-FMRP/CIB). Through the Enrichr platform, in silico pathway enrichment analyses were performed with correlated genes. In vitro, functional assays were conducted after VRK1 inhibition by shRNA in the USP-13 and D283-Med cell lines. Statistical analyses were performed using SPSS and GraphPad Prism software. Patients with higher VRK1 expression are associated with cases of metastasis, unfavorable clinical outcomes, and lower overall survival rates (p<0.05). VRK1 gene expression is significantly lower in normal cerebellum samples compared to tumor samples (MB) (p<0.05). Genes correlated with VRK1 (|R| ≥ 0.3) were enriched in pathways regulating the cell cycle, mTOR, MAP, AMPK, and p53 (p<0.05). Among the molecular subgroups of MB, VRK1 expression was higher in the G3 subgroup compared to SHH, as well as in cell lines classified as group 3/4 (p<0.0001). In vitro, VRK1 gene silencing impacted cell proliferation, colony formation, migration, and cell invasion in both cell lines (p<0.0001). We observed that VRK1 is overexpressed in unfavorable characteristics and in the subgroup with a worse prognosis, MB-G3. The correlated genes influence important cellular mechanisms and pathways in the tumoral progression of MB. The depletion of VRK1 suppressed proliferative, migratory, and invasive mechanisms. We suggest that VRK1 influences tumoral progression in MB-G3, making it a promising therapeutic target for this tumor.