Thèse de Doctorat
DOI
https://doi.org/10.11606/T.11.2003.tde-07012004-134906
Document
Auteur
Nom complet
Aurelio Mendes Aguiar
Adresse Mail
Unité de l'USP
Domain de Connaissance
Date de Soutenance
Editeur
Piracicaba, 2003
Directeur
Jury
Souza Junior, Claudio Lopes de (Président)
Miranda Filho, Jose Branco de
Ramalho, Magno Antonio Patto
Rezende, Gabriel Dehon Sampaio Peçanha
Souza, Anete Pereira de
Titre en portugais
Uso do delineamento III com marcadores moleculares para a análise genética da produção de grãos e seus componentes em milho.
Mots-clés en portugais
análise genética
componentes de variância
grãos
marcador molecular
milho
produção agrÃcola
variação genética.
Resumé en portugais
O delineamento III foi proposto para estimar as variâncias aditivas e de
dominância e o grau médio de dominância de caracteres quantitativos. Com o advento
dos marcadores moleculares, Cockerham & Zeng (1996) desenvolveram uma
metodologia genético-estatÃstica associando o delineamento III com marcadores
moleculares. Esta metodologia foi proposta visando estimar, com o uso de quatro
contrastes ortogonais, os efeitos aditivos, dominantes e epistáticos dos QTLs ligados a
marcadores moleculares. O objetivo desta pesquisa foi usar ambas as metodologias para
análise genética da produção de grãos, componentes da produção e número de
ramificações do pendão em uma população referência F2 de milho. Duzentos e cinqüenta
progênies F2:3 foram retrocruzadas com ambas linhagens genitoras, dando origem a 500
progênies de retrocruzamento. Estas progênies foram alocadas em cinco látices 10x10 e
avaliadas em seis ambientes em três estações experimentais próximas a Piracicaba, SP,
com duas repetições por ambientes. Estimativas de variância aditiva e de dominância,
assim como o grau médio de dominância dos caracteres avaliados, apresentaram
magnitudes similares às reportadas em populações de milho temperado para todos os
caracteres. Estimativas do grau médio de dominância foram inferiores a um para o diâmetro da espiga, número de fileiras, peso de 500 grãos e número de ramificações do
pendão, mostrando que os efeitos aditivos foram mais importantes que os efeitos de
dominância para estes caracteres. Para prolificidade, comprimento da espiga e número
de grãos por fileira, o grau médio de dominância não diferiu de dominância completa,
sugerindo que os efeitos de dominância foram importantes para estes caracteres. Para
produção de grãos, o resultado do grau médio de dominância sugeriu sobredominância.
Porém, como é conhecido, o desequilÃbrio de ligação causa viéses nas estimativas de
grau médio de dominância e, conseqüentemente, estas estimativas podem ser menores,
sendo que, provavelmente tenha ocorrido pseudo-sobredominância para produção de
grãos. A análise do delineamento III com marcadores moleculares mostrou que os QTLs
estão distribuÃdos em todos os cromossomos para todos caracteres. As somas em módulo
dos efeitos dos QTLs mostraram que para produção de grãos, prolificidade,
comprimento da espiga, e número de grãos por fileira, os efeitos de dominância foram
superiores aos efeitos aditivos, e estes superiores aos efeitos epistáticos; para diâmetro
da espiga, peso de 500 grãos, número de fileiras, e número ramificações do pendão, os
efeitos aditivos foram maiores que os efeitos de dominância, e estes superiores aos
efeitos epistáticos, exceto para número de fileiras em que os efeitos epistáticos foram
maiores que os efeitos de dominância. Os efeitos epistáticos foram detectados para todos
caracteres e contribuÃram mais para os componentes da produção que para a produção de
grãos per se. A análise clássica do delineamento III e a associada a marcadores
moleculares forneceram resultados de grande utilidade, mas o delineamento III com
marcadores permitiu a estimação dos efeitos genéticos de regiões especÃficas do genoma
e sugeriu que os efeitos epistáticos foram muito importantes na expressão e na herança
dos caracteres analisados.
Titre en anglais
Use of the design III with molecular markers for the genetic analysis of grain yield and its components in maize.
Mots-clés en anglais
agricultural yield.
genetic analysis
genetic variance
grain
maize
molecular marker
variance components
Resumé en anglais
The Design III was proposed to estimate additive and dominance variances, and the average levels of dominance of quantitative traits. With the advent of the molecular markers, Cockerham & Zeng (1996) developed a genetic-statistical procedure using the Design III with molecular markers. This procedure was designed to estimate additive,
dominance and epistatic effects of the QTLs linked to molecular markers from four
orthogonal contrasts. The objectives of this research were to use both methodologies for
the genetic analysis of grain yield, yield components, and number of tassel branches in
an F2 reference maize population. Two-hundred and fifty F2:3 progenies were backcrossed to the two parental inbred lines, which gave rise to 500 backcrossed progenies. These progenies were allocated in five 10x10 lattices design, and evaluated in six environments in three experimental stations near Piracicaba, SP, with two replications per environment. Estimates of additive and dominance variances, as well as the average levels of dominance for the traits evaluated, had magnitudes similar to those already
reported for temperate maize populations for all traits. Estimates of the average level of
dominance were lower than one for ear diameter, kernel row number, weight of 500 kernels, and tassel branches number, showing that the additive effects were more important than the dominance effects for these traits. For prolificacy, ear length, and kernels per row number, the average levels of dominance did not differ from complete
dominance, suggesting that the dominance effects were important for these traits. For grain yield, the result suggested overdominance as the average level of dominance. However, as is well-known, linkage disequilibrium causes biases in the estimates of the average levels of dominance and, therefore, these estimates could be lower, and probably for grain yield a pseudo-overdominance was detected. The analysis of the Design III with
molecular markers showed that QTLs were distributed in all chromosomes for all traits.
The sum in module of the QTLs effects showed that for grain yield, prolificacy, ear length, and kernels per row number, dominance effect was greater than additive effect, and the latter greater than epistatic effect; whereas for ear diameter, weight of 500 kernels, kernel row number, and tassel branches number, additive effect was greater than dominance effect, and the latter greater than epistatic effect, except for kernel row number where epistatic effect was greater than dominance effect. Epistatic effects were detected for all traits, and had higher contribution for the yield components than for yield per se. Both traditional and QTL analysis of the Design III presented very useful results,
but the Design III with molecular markers allowed the estimation of the genetic effects from specific genomic regions, and suggested that the epistatic effects play a very important role for the expression and inheritance of the traits assessed.
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Date de Publication
2004-02-02
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