• JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
  • JoomlaWorks Simple Image Rotator
 
  Bookmark and Share
 
 
Master's Dissertation
DOI
https://doi.org/10.11606/D.11.2022.tde-12072022-141606
Document
Author
Full name
Joyce Dellavechia Ferreti
E-mail
Institute/School/College
Knowledge Area
Date of Defense
Published
Piracicaba, 2022
Supervisor
Committee
Vitorello, Claudia Barros Monteiro (President)
Bressiani, José Antonio
Verdi, Maria Carolina Quecine
Title in English
Genetic analysis of ROS modulation in Sporisorium scitamineum - energy cane interaction
Keywords in English
Antioxidant system
Breeding programs
Differentially expressed genes
Reactive oxygen species
Smut diseases
Abstract in English
Energy cane is a crop developed for bioenergy production and shows a high economic potential for the country. Considering the energy cane increasing relevance, studies on the factors that may impact crop production are particularly important. Among loss production causes, the biotrophic fungus Sporisorium scitamineum causal agent of smut disease, is a concern in the development of new resistant varieties given the yield decrease caused by the disease. Therefore, several studies have been developed to improve the understanding of host defense mechanisms to improve genetic breeding programs and disease control. In this study, a genetic analysis was performed for host defense aspects related to reactive oxygen species (ROS) metabolism of susceptible (Vertix1) and resistant (Vertix2) energy cane genotypes in interaction with S. scitamineum. This dissertation is submitted in the format of 3 chapters, beginning with a review in chapter 1. In chapter 2, analyses from the two genotypes transcriptome were performed to further understand the genetic modulation involved in ROS metabolism at 48 hours post-inoculation with S. scitamineum. Differentially expressed genes (DEGs), related to ROS metabolism, were observed in common in both genotypes due the fungal presence, however showed contrasting expression patterns. Specific DEGs were also functionally analyzed for resistant and susceptible varieties against smut inoculation. In the third chapter, the results obtained through gene expression analysis of genes related to the antioxidant system, triggered by the oxidative stress response in the interaction at 48 hpi and 72 hpi, showed significant differences for TRX gene (in susceptible genotype) and SOD gene (in resistant genotype) only for analyses at 48 hpi. We observed in energy cane varieties a different pattern than already studied for conventional sugarcane in S. scitamineum interaction, involving these same ROS modulation genes. This knowledge is relevant for the new research development related to genetic breeding strategies for energy cane genotypes regarding smut disease resistance.
Title in Portuguese
Análise genética da modulação do metabolismo de espécies reativas de oxigênio na interação cana-energia - Sporisorium scitamineum
Keywords in Portuguese
Doença do carvão
Espécies reativas de oxigênio
Genes diferencialmente expressos
Melhoramento genético
Sistema antioxidante
Abstract in Portuguese
A cana-energia é uma cultura desenvolvida para produção de bioenergia que apresenta grande potencial econômico para o país, diante de sua crescente importância destaca-se estudos sobre aspectos que podem afetar a produção da cultura. Dentre estes aspectos, a doença do carvão causada pelo fungo biotrófico Sporisorium scitamineum é uma preocupação no desenvolvimento de novas variedades devido à redução de produtividade ocasionada com a doença. Desta forma, diversos estudos vêm sendo desenvolvidos para melhor entender os mecanismos de defesa do hospedeiro, a fim aprimorar programas de melhoramento genético e controle da doença. Neste trabalho foi realizada uma análise genética sobre os aspectos de defesa do hospedeiro relacionados com o metabolismo de espécies reativas de oxigênio (ROS) de variedades de cana-energia suscetível (Vertix1) e resistente (Vertix2) na interação com S. scitamineum. Esta dissertação está apresentada na forma de 3 capítulos, começando com uma revisão no capítulo 1. No capítulo 2, análises a partir do transcriptoma das duas variedades foram realizadas com o objetivo de melhor compreender a modulação genética envolvida no metabolismo de ROS 48 horas após inoculação (hai) com S. scitamineum. Foram observados genes diferencialmente expressos (DEGs), relacionados ao metabolismo de ROS, em comum nas duas variedades devido à presença do fungo, porém com padrões de expressão contrastantes. Também foram analisados funcionalmente DEGs específicos para variedades resistentes e suscetíveis. No terceiro capítulo, os resultados obtidos através da análise de expressão gênica dos genes relacionadas ao sistema antioxidante, desencadeado pela resposta de estresse oxidativo na interação em 48 hai e 72 hai, mostraram diferenças significativas apenas para análises em 48 hai, em que a atividade de SOD (superóxido dismutase) foi reprimida na variedade Vertix 2 e de TRX (Thiredoxina) reprimida na variedade Vertix1. Considerando, nestas variedades de cana-energia, um padrão diferente do já estudado para variedades de cana-de-açúcar convencional na interação com S. scitamineum, envolvendo estes mesmos genes de modulação de ROS. Estas informações são relevantes para o desenvolvimento de novas pesquisas relacionadas a estratégias para o melhoramento genético de cana-energia quanto à doença do carvão.
 
WARNING - Viewing this document is conditioned on your acceptance of the following terms of use:
This document is only for private use for research and teaching activities. Reproduction for commercial use is forbidden. This rights cover the whole data about this document as well as its contents. Any uses or copies of this document in whole or in part must include the author's name.
There are withheld file due to requirements (data publishing, patents or rights).
Release Date
2024-05-13
Publishing Date
2022-07-15
 
WARNING: Learn what derived works are clicking here.
All rights of the thesis/dissertation are from the authors
CeTI-SC/STI
Digital Library of Theses and Dissertations of USP. Copyright © 2001-2024. All rights reserved.