Protozoários da família Trypanosomatidae, representam importante papel para saúde humana e animal, apresentando ciclos de vida monoxeno e heteroxeno, onde na alternância de hospedeiros, podem infectar o ser humano. O gênero Leishmania possui ciclos silveste e urbano, infectando principalmente mamíferos silvestres e cães domésticos como hospedeiros vertebrados. As espécies do gênero Leishmania são transmitidas a estes hospedeiros através da picada de invertebrados hematófagos da família Psychodidae, e possui duas apresentações clínicas principais quando infecta o ser humano: visceral e cutânea; onde a forma visceral é causada pela espécie Leishmania (Leishmania ) infantum na America e Europa, e pela espécie Leishmania (Leishmania ) donovani na Ásia. A Leishmaniose Visceral está classificada como uma das Doenças Tropicais Negligenciadas pela OMS. O gênero Trypanosoma possui uma subdivisão baseada no desenvolvimento dos parasitas no trato digestivo do vetor; em duas Secções, Salivaria e Stercoaria, além também das divisões em diversos Clados, baseado em filogenia molecular; e a separação em três subgêneros: Herpetosoma, Megatrypanum e Schizotrypanum. No subgênero Schizotrypanum está classificada a espécie Trypanosoma cruzi, que possui bastante complexidade epidemiológica, e capacidade de infectar mamíferos de todas as ordens, inclusive o ser humano. No ser humano o T. cruzi causa a Doença de Chagas, transmitida por diversas espécies de triatomíneos dos gêneros Triatoma, Rodnius e Panstrongylus. A Doença de Chagas também está classificada no grupo das Doenças Tropicais Negligenciadas da OMS. O presente estudo teve como objetivo investigar a ocorrência de parasitas dos gêneros Trypanosoma e Leishmania na Reserva Legado das Aguas Votorantim, na região do Vale do Ribeira, sul do estado de São Paulo, uma região de Mata Atlântica preservada, a fim de contribuir para o melhor entendimento dos ciclos de transmissão desses parasitas, e acrescentar conhecimento ao estudo dessas zoonoses. Foram capturados 324 pequenos mamíferos das ordens Rodentia, Chiroptera e Marsupialia, através de armadilhas do tipo gaiolas e redes de neblina. Foi coletado sangue e tecidos destes animais, onde o sangue foi distribuído em hemoculturas e ambos submetidos a testes moleculares. Foram também capturados triatomíneos (barbeiros) e tabanídeos (mutucas), através de busca ativa e redes de neblina (para tabanídeos). As hemoculturas não demonstraram crescimento de parasitas, e a análise molecular corroborou tais resultados negativos. Foram capturados 16 espécimes de triatomíneos, dos gêneros Triatoma e Panstrongylus. Através destes foram obtidos 11 isolados classificados como Trypanosoma cruzi II, e uma sequência obtida classificada como Trypanosoma cruzi IV. Foram capturados três tabanídeos, que possibilitou a obtenção de duas sequências de conteúdo intestinal, caracterizadas como Trypanosoma terrestris. Estes tabanídeos ainda serão classificados a nível de espécie através da análise molecular. Através da captura de animais foi possível atestar a biodiversidade e nível de preservação ambiental da Reserva Legado das Aguas Votorantim, e ainda demonstrar que há a circulação de parasitas do gênero Trypanosoma em vetores e potenciais vetores, necessitando ainda de mais estudos para determinar quais vertebrados mantem os ciclos ativos, e ainda determinar a capacidade vetorial de tabanídeos para a espécie Trypanosoma terrestris, que ainda não possui vetores caracterizado.

Protozoa of the Trypanosomatidae family, play an important role for human and animal health, presenting monoxene and heteroxene life cycles, where in alternating hosts, they can infect humans. The Leishmania genus has wild and urban cycles, mainly infecting wild mammals and domestic dogs as vertebrate hosts. The species of the genus Leishmania are transmitted to these hosts through the bite of blood-sucking invertebrates of the Psychodidae family, and it has two main clinical presentations when it infects humans: visceral and cutaneous; where the visceral form is caused by the species Leishmania (Leishmania) infantum in America and Europe, and by the species Leishmania (Leishmania) donovani in Asia. Visceral Leishmaniasis is classified as one of the Neglected Tropical Diseases, by the WHO. The Trypanosoma genus has a subdivision based on the development of parasites in the vector's digestive tract; in two Sections, Salivaria and Stercoaria, in addition to the divisions in several Clados, based on molecular phylogeny; and the separation into three subgenera: Herpetosoma, Megatrypanum and Schizotrypanum. In the subgenus Schizotrypanum, the species Trypanosoma Cruzi is classified, which has a lot of epidemiological complexity, and is capable of infecting mammals of all orders, including humans. In humans, T. cruzi causes Chagas disease, transmitted by several species of triatomines of the genera Triatoma, Rodnius and Panstrongylus. Chagas' disease is also classified in the WHO Neglected Tropical Diseases group. The present study aimed to investigate the occurrence of parasites of the genera Trypanosoma and Leishmania in the Legado das Aguas Reserve - Votorantim, in the Vale do Ribeira region, south of the state of São Paulo, a region of preserved Atlantic Forest, in order to contribute to better understanding of the transmission cycles of these parasites, and adding knowledge to the study of these zoonoses. 324 small mammals of the orders Rodentia, Chiroptera and Marsupialia were captured, using cage-type traps and mist nets. Blood and tissues were collected from these animals, where the blood was distributed in blood cultures and both subjected to molecular tests. Triatomines and tabanids were also captured, through active search and fog nets (for tabanids). Blood cultures did not show parasite growth, and molecular analysis corroborated these negative results. 16 specimens of triatomines, of the genera Triatoma and Panstrongylus, were captured. Through these 11 isolates classified as Trypanosoma cruzi II were obtained, and a sequence obtained classified as Trypanosoma cruzi IV. Three tabanids were captured, which made it possible to obtain two sequences of intestinal content, characterized as Trypanosoma terrestris. These tabanids will still be classified at the species level through molecular analysis. Through the capture of animals it was possible to attest to the biodiversity and environmental preservation level of the Legado das Aguas Reserve - Votorantim, and to demonstrate that there is the circulation of parasites of the genus Trypanosoma in vectors and potential vectors, requiring further studies to determine which vertebrates keeps the cycles active, and also determine the vectorial capacity of tabanids for the species Trypanosoma terrestris, which does not yet have characterized vectors.