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Thèse de Habilitation à Diriger des Recherches
DOI
10.11606/T.11.2014.tde-02092014-095652
Document
Auteur
Nom complet
Fernando Dini Andreote
Adresse Mail
Unité de l'USP
Domain de Connaissance
Date de Soutenance
Editeur
Piracicaba, 2014
Jury
Cardoso, Elke Jurandy Bran Nogueira (Président)
Cerri, Carlos Eduardo Pellegrino
Maldonado, Gabriel Padilla
Melo, Vania Maria Maciel
Moreira, Fatima Maria de Souza
Titre en portugais
Estrutura e função do microbioma de solos brasileiros
Mots-clés en portugais
Biodiversidade
Ecologia microbiana
Métodos independentes de cultivo
Microbiologia do solo
Resumé en portugais
O conhecimento da diversidade microbiana é um dos temas mais explorados dentro da ciência nos últimos anos. O recente acesso a grande maioria dos microrganismos, com base em metodologias independentes de cultivo, deu origem ao termo microbioma, uma das áreas mais recheadas de novidades, e uma das linhas de pesquisa mais promissoras na busca por inovações teóricas e tecnológicas. Dentre todos os ambientes, o solo é aquele que hospeda a maior diversidade microbiana, composta por valores de aproximadamente 109 células microbianas por grama de solo, divididas em algo em torno de 10 mil a 30 mil diferentes ‘espécies’. Este manuscrito visa portanto, demonstrar os avanços realizados no estudo do microbioma presente em solos brasileiros, oriundos de áreas naturais, como manguezais ou solos da caatinga nordestina; e solos utilizados para a produção agrícola, com destaque para aqueles cultivados com cana-de-açúcar. Dentro do estudo das áreas naturais, destacam-se os avanços realizados nos solos de manguezais, onde o microbioma foi descrito, tanto com base na taxonomia, como na base funcional deste ambiente em diferentes estados de contaminação. Com relação às áreas agrícolas, solos cultivados com cana-de-açúcar estão sendo estudados, visando a detecção de padrões biogeográficos na estruturação do microbioma de tais áreas, bem como auxiliando na descrição dos grupos microbianos intimamente relacionados com as plantas
Titre en anglais
Structure and functioning of the microbiome in brazilian soils
Mots-clés en anglais
Biodiversity
Culture-independent methods
Microbial ecology
Soil microbiology
Resumé en anglais
The knowledge on microbial diversity is one of the most revolutionary themes in science in the last years. The recent assess to the majority of microorganisms, based on culture- independent methodologies, originated the term microbiome, one of the field most filled with novelties, and one of the most promising research line in the search for theoretical and technological innovations. Among all environments, soils harbor the bigger microbial diversity, being it composed by values of approximately 109 microbial cells per gram of soil, spread in something around 10 to 30 thousands distinct ‘species’. This manuscript aim to demonstrate the advances promoted in the assessment of microbiomes in Brazilian soils, encompassing natural areas, such as mangroves and soils from the Northwest Caatinga; or soils used for agriculture, remarking the soils cultivated with sugarcane. Among the studies performed in natural areas, it is highlighted the advances achieved in mangrove soils, where the microbiome was described based on taxonomical units, and also in the functional features, found in this ecosystem under distinct levels of contamination. Concerning agricultural fields, soils cultivated with sugarcane have been addressed, supporting the detection of biogeographical patterns in the structuring of microbial communities, and being used for the description of microbial groups intimately interacting with plants
 
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Date de Publication
2014-09-04
 
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