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Tese de Doutorado
DOI
10.11606/T.54.1993.tde-18042007-143803
Documento
Autor
Nome completo
Gonzalo Travieso
Unidade da USP
Área do Conhecimento
Data de Defesa
Imprenta
São Carlos, 1993
Orientador
Banca examinadora
Slaets, Jan Frans Willem (Presidente)
Bergamini, Eduardo Whitaker
Costa, Luciano da Fontoura
Koberle, Roland
Rino, José Pedro
Título em português
Proposta e implementação de um sistema de processamento paralelo para dinâmica molecular.
Palavras-chave em português
Dinâmica molecular
Processamento paralelo
Processos seqüênciais comunicantes
Resumo em português
Neste trabalho, propomos um método de paralelização de simulações de dinâmica molecular para execução em máquinas de memória distribuída, trabalhando sob passagem de mensagens. Nos limitamos à análise de implementação de sistemas com ensemble microcanônico de partículas de Lennard-Jones, desenvolvendo no entanto um sistema que pode ser expandido para incluir outras características. Mostramos que o sistema apresenta bom desempenho com relação à paralelização, representando uma alternativa viável para a simulação de sistemas com muitas partículas.
Título em inglês
Proposal and implementation of a parallel processing system for molecular dynamics.
Palavras-chave em inglês
Communicating sequential processes
Molecular dynamics
Parallel processing
Resumo em inglês
A method for parallelization of molecular dynamics simulations in distributed memory machines operating under the message-passing paradigm is proposed. Even though the analysis and implementation presented in this work were primarily restricted to the system model known as microcanonical emsemble of Lennard--Jones particles. the obtained system can easily be adapted for inclusion of other characteristics. It is shown t,hat. the developed system is well suited for parallelization, resulting in a feasible a1ternative for simulation of many-particle systems.
 
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Gonzalo.pdf (3.91 Mbytes)
Data de Publicação
2007-04-20
 
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