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Thèse de Doctorat
DOI
https://doi.org/10.11606/T.54.1993.tde-18042007-143803
Document
Auteur
Nom complet
Gonzalo Travieso
Unité de l'USP
Domain de Connaissance
Date de Soutenance
Editeur
São Carlos, 1993
Directeur
Jury
Slaets, Jan Frans Willem (Président)
Bergamini, Eduardo Whitaker
Costa, Luciano da Fontoura
Koberle, Roland
Rino, José Pedro
Titre en portugais
Proposta e implementação de um sistema de processamento paralelo para dinâmica molecular.
Mots-clés en portugais
Dinâmica molecular
Processamento paralelo
Processos seqüênciais comunicantes
Resumé en portugais
Neste trabalho, propomos um método de paralelização de simulações de dinâmica molecular para execução em máquinas de memória distribuída, trabalhando sob passagem de mensagens. Nos limitamos à análise de implementação de sistemas com ensemble microcanônico de partículas de Lennard-Jones, desenvolvendo no entanto um sistema que pode ser expandido para incluir outras características. Mostramos que o sistema apresenta bom desempenho com relação à paralelização, representando uma alternativa viável para a simulação de sistemas com muitas partículas.
Titre en anglais
Proposal and implementation of a parallel processing system for molecular dynamics.
Mots-clés en anglais
Communicating sequential processes
Molecular dynamics
Parallel processing
Resumé en anglais
A method for parallelization of molecular dynamics simulations in distributed memory machines operating under the message-passing paradigm is proposed. Even though the analysis and implementation presented in this work were primarily restricted to the system model known as microcanonical emsemble of Lennard--Jones particles. the obtained system can easily be adapted for inclusion of other characteristics. It is shown t,hat. the developed system is well suited for parallelization, resulting in a feasible a1ternative for simulation of many-particle systems.
 
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Gonzalo.pdf (3.91 Mbytes)
Date de Publication
2007-04-20
 
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