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Tesis Doctoral
DOI
https://doi.org/10.11606/T.54.1993.tde-18042007-143803
Documento
Autor
Nombre completo
Gonzalo Travieso
Instituto/Escuela/Facultad
Área de Conocimiento
Fecha de Defensa
Publicación
São Carlos, 1993
Director
Tribunal
Slaets, Jan Frans Willem (Presidente)
Bergamini, Eduardo Whitaker
Costa, Luciano da Fontoura
Koberle, Roland
Rino, José Pedro
Título en portugués
Proposta e implementação de um sistema de processamento paralelo para dinâmica molecular.
Palabras clave en portugués
Dinâmica molecular
Processamento paralelo
Processos seqüênciais comunicantes
Resumen en portugués
Neste trabalho, propomos um método de paralelização de simulações de dinâmica molecular para execução em máquinas de memória distribuída, trabalhando sob passagem de mensagens. Nos limitamos à análise de implementação de sistemas com ensemble microcanônico de partículas de Lennard-Jones, desenvolvendo no entanto um sistema que pode ser expandido para incluir outras características. Mostramos que o sistema apresenta bom desempenho com relação à paralelização, representando uma alternativa viável para a simulação de sistemas com muitas partículas.
Título en inglés
Proposal and implementation of a parallel processing system for molecular dynamics.
Palabras clave en inglés
Communicating sequential processes
Molecular dynamics
Parallel processing
Resumen en inglés
A method for parallelization of molecular dynamics simulations in distributed memory machines operating under the message-passing paradigm is proposed. Even though the analysis and implementation presented in this work were primarily restricted to the system model known as microcanonical emsemble of Lennard--Jones particles. the obtained system can easily be adapted for inclusion of other characteristics. It is shown t,hat. the developed system is well suited for parallelization, resulting in a feasible a1ternative for simulation of many-particle systems.
 
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Gonzalo.pdf (3.91 Mbytes)
Fecha de Publicación
2007-04-20
 
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