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Mémoire de Maîtrise
DOI
https://doi.org/10.11606/D.46.2018.tde-18092018-153959
Document
Auteur
Nom complet
Fabio Passetti
Adresse Mail
Unité de l'USP
Domain de Connaissance
Date de Soutenance
Editeur
São Paulo, 2002
Directeur
Jury
Souza, Sandro José de (Président)
Verjovski-Almeida, Sergio
Zanotto, Paolo Marinho de Andrade
Titre en portugais
Diversidade na arquitetura e expressão gênica: uma análise quantitativa de Exon shuffling e splicing alternativo
Mots-clés en portugais
Bioinformática
DNA recombinante
Expressão gênica
Genomas (Estudo)
Transcrição gênica
Transcriptoma
Resumé en portugais
A função e a arquitetura dos genes está começando a ser elucidada a partir do estudo de genomas completos tanto de procariotos como de eucariotos. Diversos estudos foram ultimamente realizados a respeito de exon shuffling do ponto de vista evolutivo, fenômeno relacionado à origem de novos genes através de recombinações de DNA mediadas por introns. Apesar de eventos de exon shuffling serem responsáveis pelo aumento da modularidade gênica, outros processos foram desenvolvidos ao longo da evolução para que houvesse o aumento da diversidade do proteoma sem a conseqüente expansão dos genomas, sendo splicing alternativo um dos mais freqüentes. Apresentamos nesta dissertação duas extensivas análises: 1) a análise de uma base de dados de genes eucarióticos contendo pelo menos um intron que apresentou excesso de introns de fase 0 e exons simétricos, dados que suportam exon shuffling como um importante mecanismo de evolução gênica. Avaliamos também a confiabilidade de introns preditos por programas de computador através de alinhamento de ESTs; e 2) a análise do uso alternativo de exons (UAE), um tipo de splicing alternativo, em transcritos humanos detectando que cerca de 51% dos genes humanos possuem mais de uma variante de splicing e que este tipo de processamento pós-transcricional parece ser mais freqüentemente encontrado em tecidos tumorais.
Titre en anglais
Diversity in architecture and gene expression: a quantitative analysis of Exon shuffling and alternative splicing
Mots-clés en anglais
Bioinformatics
Gene expression
Gene transcription
Genomes (Study)
Recombinant DNA
Transcriptome
Resumé en anglais
Abstract not available.
 
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Date de Publication
2018-09-18
 
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