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Thèse de Doctorat
DOI
https://doi.org/10.11606/T.43.2005.tde-06032014-145338
Document
Auteur
Nom complet
Valdemir Eneias Ludwig
Unité de l'USP
Domain de Connaissance
Date de Soutenance
Editeur
São Paulo, 2005
Directeur
Jury
Canuto, Sylvio Roberto Accioly (Président)
Custódio, Rogério
Freitas, Luiz Carlos Gomide
Santos, Maria Cristina dos
Souza, Gerardo Gerson Bezerra de
Titre en portugais
Estrutura eletrônica e interações intermoleculares em líquidos
Mots-clés en portugais
Estrutura eletrônica
Matéria condensada
Resumé en portugais
As interações intermoleculares em meio líquido foram estudadas através do uso de uma metodologia sequencial que combina simulações clássicas com cálculos de mecânica quântica. Estudamos, em ordem crescente de complexidade, os efeitos de uma carga em meio líquido, o sódio em hélio líquido e moléculas complexas (benzotriazol e aminonopurina) em meio aquoso. As estruturas do líquido foram geradas usando simulações clássicas de Monte Carlo. Os efeitos das interações soluto-solvente foram obtidos através do cálculo de propriedades eletrônicas em meio líquido. Valores médios para a energia de ligação, energia de transição eletrônica e momento de dipolo de estados eletrônico fundamental e excitados foram calculados para estruturas descorrelacionadas obtidas na simulação. A variação das propriedades dos níveis eletrônicos pode ser correlacionada com o deslocamento solvatocrômico medido diretamente para a molécula em meio líquido e em fase gasosa. Esta metodologia vem sendo usada com a combinação do método de Monte Carlo com cálculos semiempíricos. Um passo adicional dado nesta tese é a combinação do método Monte Carlo com métodos quânticos de primeiros princípios, multiconfiguracionais e baseados em teoria do funcional da densidade. Dentre as interações intermoleculares foram consideradas também as ligações de hidrogênio formadas na interação soluto-solvente. O caso específico estudado foi a hidratação do par de bases guanina-citosina.
Titre en anglais
Electronic Structure Intermolecular Interactions Liquids
Mots-clés en anglais
Condensed matter
Electronic structure
Resumé en anglais
Molecular interactions in liquid environment were studied by a sequential methodology combining classical simulations with quantum mechanical calculations. We studied, an increase of difficulty, the effects of a charge in aqueous environment, the sodium atomem liquid helium and complex molecules like benzotriazole and aminopurine in aqueous environment. The structures of the liquid were generated with classical Monte Carlo simulations. The effects of the solute-solvent interactions were obtained by electronic proprieties in liquid environment. Averaged values for interaction energies, electronic transition energies and dipole moments in fundamental and excited states were calculated with uncorrelated configurations obtained during the simulations. The change of the proprieties can be correlated with the solvatocromic shift which can be directly measured for molecules in liquid and in gas phase. This methodology was used in combination of Monte Carlo method with semi-empirical calculations. An additional step implemented in this thesis is the combination of Monte Carlo simulation with first principle calculations like multiconfigurational and density functional theory based calculations. Among the intermolecular interactions, the hydrogen bond interactions formed in the solute-solvent interaction. An specific case studied was the hydration of the guanine-cytosine base pair.
 
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46898LudwigEneias.pdf (1.22 Mbytes)
Date de Publication
2014-03-12
 
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