O presente trabalho teve como objetivos avaliar a micobiota e a ocorrência de micotoxinas em grãos de milho provenientes de quatro regiões do Brasil; identificar os isolados de A. flavus pela técnica de AFLP (Amplified Fragment Length Plymorphism) e de Fusarium verticillioides, utilizando as técnicas de AFLP e sequenciamento parcial do gene do fator de elongação 1-α; comparar o potencial toxigênico das cepas com a expressão dos genes aflR e aflP (A. flavus) e FUM1 e FUM19 (F. verticillioides), através da técnica de real time RT-PCR. Demonstrou-se prevalência de Fusarium verticillioides e de fumonisinas nos grãos. Do total de isolados, 96 % foram identificados como F. verticillioides. A similaridade dos isolados de A. flavus com a cepa padrão variou de 79 % a 100 %, e não foi observado agrupamento origem geográfica específico entre os isolados de A. flavus e F. verticillioides. Observou-se elevada correlação positiva entre a expressão de FUM1 e FUM19 e a produção de toxinas por F. verticillioides, e baixa correlação positiva entre os transcritos de aflR e aflP em relação ao perfil de produção de aflatoxinas por A. flavus, demonstrando necessidade de estudos referentes a expressão de genes relacionados à produção de micotoxinas.

The present study aimed to verify the mycoflora and occurrence of mycotoxins in freshly harvested corn samples in four regions of Brazil; to identify Aspergillus flavus strains by AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism) technique and Fusarium verticillioides by AFLP and by the translation elongation factor 1-α partial gene sequencing (TEF-1-α); to compare the toxigenic potential of the strains in relation to aflR and aflP gene expression (A. flavus) and FUM1 and FUM19 (F. verticillioides), using Real Time RT-PCR technique. Our data showed predominance of F. verticillioides and fumonisins in the corn samples. Of the total strains, 96 % were identified as F. verticillioides. The similarity of A. flavus isolates with the standard strain ranged from 79 % to 100 %, and the results of AFLP, demonstrated a lack of relationship between the groups of the phylogenetic tree and the different geographic origins, for both A. flavus and F. verticillioides. A high positive correlation was observed between the expression of FUM1 and FUM19 genes and fumonisin production, and a low positive correlation was observed between the expression of aflR and aflP genes and aflatoxin production. These data demonstrate the need for studies concerning gene expression related to mycotoxins production.