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Tese de Doutorado
Documento
Autor
Nome completo
Ronaldo Barros de Freitas
Unidade da USP
Área do Conhecimento
Data de Defesa
Imprenta
São Paulo, 2008
Orientador
Banca examinadora
Durigon, Edison Luiz (Presidente)
Granato, Celso Francisco Hernandes
Jerez, José Antonio
Lima, Lourdes Rehder de Andrade Vaz de
Oliveira, Maria Isabel de
Título em português
Caracterização molecular de eritrovírus humano B19 isolados na região amazônica.
Palavras-chave em português
Análise filogenética
Eritrovírus B19
Evolução de eritrovírus
Genótipos 1 e 3
Manifestações clínicas
Seleção natural
Resumo em português
Para avaliar a circulação e freqüência dos genótipos de eritrovírus na região amazônica, foi analisado um total de 487 amostras de soros/plasmas colhidas de pacientes apresentando sintomas e sinais clínicos sugestivos de infecção pelos eritrovírus. O ensaio imunoenzimático foi utilizado para detecção de anticorpos específicos para B19, das classes IgM/IgG, e a reação em cadeia da polimerase/semi-nested PCR para detecção do DNA. Das 487 amostras examinadas, 117 (24%) mostraram a presença do DNA dos eritrovírus, sendo todas as 117 foram posteriormente seqüenciadas e genotipadas. A maioria dos isolamentos foi classificada como genótipo 1 (91% das amostras) e 3b (9% ). Também observamos três diferentes grupos dentro do genótipo 1 (A1, A2, B). Conseqüentemente, estas linhagens de B19 introduzidas em Belém apresentaram uma elevada taxa de mudanças dos aminoácidos, decorrência da pressão seletiva, gerando reinfecções consecutivas em uma pequena rede de transmissão, metaforicamente comparada a uma "panela de pressão evolutiva".
Título em inglês
Molecular characterization of the human erythrovirus B19 in the amazon region.
Palavras-chave em inglês
Clinical manifestations
Erythrovirus B19
Erytrovirus evolution
Genotypes 1 and 3
Natural selection
Phylogenetic analysis
Resumo em inglês
To assess the circulation and relative frequency of erythrovirus genotypes in clinical samples from patients living in the Amazon region we screened a total of 487 samples from patients suffering from different clinical manifestations suggestive of erythrovirus infections. Enzyme-linked immunosorbent assay was used to detect B19-specific IgM/IgG antibodies and polymerase chain reaction/ semi-nested PCR for viral DNA detection. Of the 487 samples 117 (24%) were positive for the erythrovirus DNA and all 117 isolates were sequenced and genotyped analyzing a fragment of 476 bp of VP1 and VP2 gene sequences of the erythrovirus. The majority of isolates was classified as genotype 1 (91% of the samples) and 3b (9% of the samples). We also reported three different clusters (A1, A2, B) within genotype 1. Our analysis revealed a strikingly different pattern of evolutionary change for those viral lineages introduced in Belém, which exhibited a higher rate of nonsynonymous substitutions compared to those viruses sampled from other locations.
 
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Data de Publicação
2008-09-15
 
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