Aberrações cromossômicas estruturais ou numéricas estão presentes em 0,6% dos recém nascidos e são responsáveis por características fenotípicas variáveis que incluem anomalias congênitas, atraso de desenvolvimento, deficiência intelectual e infertilidade. A análise por citogenética clássica constitui a principal ferramenta para o diagnóstico de anormalidades cromossômicas, contudo, sua resolução é limitada, impossibilitando a definição do diagnóstico etiológico, ocasionando um acompanhamento médico inadequado, assim como riscos desconhecidos para a família. A hibridação genômica comparativa por microarranjos (aCGH) é uma técnica que permite a análise de todo o genoma humano, identificando com precisão qualquer região alterada e fornecendo informações sobre o número de cópias de sequências de DNA envolvidas em cada região genômica. O objetivo do projeto foi realizar investigação genômica de pacientes portadores de aberrações cromossômicas, para elucidação diagnóstica e correlação entre cariótipo, fenótipo e genótipo. Foram avaliados dez pacientes com cariótipo anormal, caracterizado por material adicional (4), translocação (1), deleção (1), cromossomo em anel (1), inversão cromossômica (1) e cromossomo marcador (2), sem diagnóstico sindrômico definido. O estudo genômico foi realizado por meio da plataforma 2x400K (Agilent,USA) e os resultados foram analisados pelo software Nexus 7.0. Técnicas de citogenética molecular, como FISH e mBand, foram aplicadas para confirmação dos pontos de quebra cromossômica e para validação dos resultados. A técnica de aCGH mostrou-se eficiente para elucidação diagnóstica, sendo possível estabelecer a correlação entre genótipo e fenótipo em oito pacientes. Os resultados permitiram relacionar o ganho genômico na região 8p23 ao fenótipo específico de dislipidemia em dois pacientes; a caracterização molecular da síndrome de Jacobsen, definindo o fenótipo característico da deleção da região 11q24.2-q25; a correlação entre os achados característicos da síndrome de Pallister-Killian e o ganho da região 12p11.21-p13.31; estabelecer o diagnóstico de trissomia do braço curto do cromossomo 8 por ganho nas regiões 8p12,8p11.22-p11.23,8p22 e 8p23.2-23.3; o refinamento diagnóstico da deleção 13q34 com perda de 127 genes mapeados no intervalo 13q-q34 e estabelecer a correlação fenotípica em um paciente com síndrome do olho do gato por ganho da região 22q11.1. Um paciente portador de inversão em ambos os braços do cromossomo 12 em homozigose apresentou ganho em 15q11.1-q11.2, compatível com fenótipo de deficiência mental, obesidade, déficit de atenção e dismorfias faciais. Os resultados obtidos confirmam a habilidade da investigação citogenômica para definição diagnóstica de pacientes portadores de anormalidades cromossômicas, sendo decisivos para o aconselhamento genético.

Structural or numerical chromosomal aberrations are detected in 0.6% of newborns and are responsible for variable phenotypic findings which include congenital anomalies, developmental delay, intellectual disability and infertility. Analysis by classical cytogenetics remains the main tool for diagnosis of chromosomal abnormalities, however, its resolution is limited, leading to inadequate medical care as well as unknown risks for the families due to undefined etiologic diagnosis. Microarray based comparative genomic hybridization (aCGH) technique allows the analysis of the whole human genome, identifying precisely any abnormal regions and providing information on the copy number of the DNA sequences involved in each genomic region. The goal of this project was to perform genomic investigation in patients with chromosomal aberrations, to further elucidate their diagnosis and to establish correlation between karyotype, phenotype and genotype. Ten patients with abnormal karyotypes, characterized by additional material ( 4 ), translocation ( 1 ), deletion ( 1 ), ring chromosome ( 1 ), chromosomal paracentric inversion ( 1 ) and chromosome marker (2) were evaluated, all of them had no syndromic diagnosis. Genomic studies were conducted using the 2x400K platform ( Agilent , USA ) and the results were analyzed by Nexus 7.0 software. Molecular cytogenetic techniques such as FISH and mBand were applied for confirmation of chromosomal breakpoints and to validate the aCGH results. The aCGH technique was highly efficient for precise diagnosis , and the genotype/phenotype correlation was established in eight patients. Our results made it possible to relate the gain in the region 8p23 to the specific phenotype of dyslipidemia in two patients; to provide molecular characterization of Jacobsen syndrome, defining the characteristic phenotype of deletion of region 11q24.2 - q25; to relate characterization of Pallister- Killian syndrome related to the gain in the region 12p11.21 - p13.31 ; to diagnose trisomy of the short arm of chromosome 8 by gains in 8p12, 8p11.22 - p11.23, 8p22 and 8p23.2 - 23.3 regions ; to improve the molecular characterization of 13q34 deletion with loss of 127 genes mapped to 13q31.2 - q34 and to provide a phenotype correlation in one patient with cat eye syndrome, characterized by the gain of 22q11.1 region. One patient with homozygous 12p12q chromosomal inversion showed 15q11.1 - q11.2 gain, consistent with his phenotype of mental retardation, attention deficit, obesity and facial dysmorphisms. Our results have confirmed the ability of cytogenomic studies to provide and improve diagnostic rates in patients with chromosomal abnormalities and in each case the findings were decisive for genetic counseling.