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Master's Dissertation
DOI
https://doi.org/10.11606/D.17.2020.tde-12022020-172728
Document
Author
Full name
Ana Beatriz Zichinelli
E-mail
Institute/School/College
Knowledge Area
Date of Defense
Published
Ribeirão Preto, 2019
Supervisor
Committee
Manfrin, Maura Helena (President)
Arias, Maria Cristina
Ravazzi, Lilian Madi
Simões, Aguinaldo Luiz
Title in Portuguese
Linhagens evolutivas na espécie taxonômica Drosophila serido (grupo D. repleta)
Keywords in Portuguese
Delimitação de espécies
Marcadores moleculares
Novas linhagens
Abstract in Portuguese
O "cluster" Drosophila buzzatii é formado por sete espécies endêmicas da América do Sul e que apresentam relação ecológica obrigatória com cactos. Entre elas, Drosophila serido possui uma distribuição geográfica muito ampla. Análises de inversões cromossômicas polimórficas, hidrocarbonetos da cutícula, diversidade haplotípica mitocondrial e análises cariotípicas apontam a existência de dois grupos populacionais de D. serido: populações do litoral e populações do nordeste. Neste trabalho, utilizando sequências dos genes nucleares GstD1, kl5 e ? esterase-5 e mitocondrial COI, testamos a hipótese de que a espécie taxonômica D. serido é composta por mais de uma linhagem evolutiva, por meio de análises de estrutura populacional, agrupamento populacional, rede haplotípica e filogenia. Os resultados para a análise de estrutura populacional apontam dois (ou mais) agrupamentos para a espécie. Para a análise de agrupamento populacional com base na distância genética, analisamos que algumas populações do litoral estão se distanciando do restante das populações do litoral e nordeste, porém ainda temos as duas populações dos dois agrupamentos hipotéticos próximas. Para a análise das redes haplotípicas, os genes que separam os dois agrupamentos são ? esterase-5 e GstD1. Para o restante dos marcadores, ainda apontam o compartilhamento de alguns haplótipos entre as populações. Nas análises filogenéticas, os genes GstD1, ? esterase-5 e os quatro analisados em conjunto separam as populações em dois agrupamentos, enquanto os marcadores COI e Kl-5 ainda têm as duas populações hipotéticas misturadas, corroborando com as outras análises. Contudo, nossos dados apoiam que existam duas linhagens evolutivas para D. serido
Title in English
Evolutive lineages of the taxonomic species Drosophila serido (D. repleta group)
Keywords in English
Delimitation of species
Molecular markers
New lineages
Abstract in English
The "cluster" Drosophila buzzatii is formed by seven endemic species from South America and have a mandatory ecological relationship with cacti. Among them, Drosophila serido has a very broad geographic distribution. Analyses of polymorphic chromosomal inversions, cuticle hydrocarbons, haplotypical mitochondrial diversity and karyotypic analyses indicate the existence of two population groups of D. serido: coastal populations and northeastern populations. In this study, using sequences of the nuclear genes GstD1, KL5 and ? Esterase-5 and mitochondrial COI, we tested the hypothesis that the taxonomic species D. serido is composed of more than one evolutionary lineage, through analysis of population structure, population grouping, haplotypical network and phylogeny. The results for the population structure analysis indicate two (or more) groupings for the species. For population cluster analysis based on genetic distance, we analyzed that some coastal populations are moving away from the rest of the coastal and northeast populations, but we still have the two populations of the two hypothetical clusters nearby. For haplotypic network analysis, the genes that separate the two clusters are ? esterase-5 and GstD1. For the remaining markers, they still point to the sharing of some haplotypes among the populations. In phylogenetic analyzes, the GstD1, ? esterase-5 and the four genes analyzed together separate the populations into two clusters, while the markers COI and Kl-5 still have the two hypothetical populations mixed, corroborating the other analyzes. However, our data support that there are two evolutionary lineages for D. serido
 
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Publishing Date
2020-03-18
 
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