O gênero Trypanosoma compreende flagelados capazes de infectar várias espécies de mamíferos e é transmitida por vários grupos de invertebrados. A ordem Chiroptera pode ser infectada pelos subgêneros Herpetosoma, Schizotrypanum, Megatrypanum e Trypanozoon. Neste estudo, foi possível descrever a diversidade de tripanossomas de morcegos, inferindo as relações filogenéticas entre os tripanossomas e os morcegos capturados na área de influência da Hidrelétrica de Belo Monte, localizada na Amazônia Brasileira. Tripanossomas de morcegos foram isolados por hemocultura, e a filogenia molecular foi baseada na subunidade menor do gene ribossômico (SSU rDNA) e de glicosomal-3-fosfato desidrogenase (gGAPDH). A caracterização morfológica incluiu microscopia eletrônica de luz e de varredura. Além das espécies já descritas, T. cruzi e T. cruzi marinkellei, foi possível identificar uma espécie não classificada, Trypanosoma sp., identificado em um morcego da espécie Pteronotus parnellii. Árvores filogenéticas usando combinado SSU rDNA e conjuntos de dados em cluster gGAPDH, confirmaram que esta espécie de tripanossoma de morcego, era muito divergente de outras espécies de tripanossomas. Através do posicionamento filogenético, foi possível classificar os tripanossomas deste morcego como uma espécie não classificada. Os tripanossomas isolados de morcegos na área de influência da Hidrelétrica de Belo Monte foram identificados através de análise filogenética como T. cruzi marinkellei, T. cruzi (TCI e TCbat) e em Pteronotus parnellii uma espécie não classificada e posicionada no Clado T. cruzi. Os dados obtidos neste estudo atentam para a diversidade subestimada de parasitas que infectam morcegos nos diferentes biomas brasileiros

The Trypanosoma comprises flagellates able to infect several mammalian species and is transmitted by several groups of invertebrates. The order Chiroptera can be infected by the subgenera Herpetosoma, Schizotrypanum, Megatrypanum and Trypanozoon. In this study, we described the diversity of bats trypanosomes, inferring the phylogenetic relationships among the trypanosomes from bats caught Belo Monte Hydroeletric area (Brazilian Amazonia). Trypanosomes from bats were isolated by haemoculture, and the molecular phylogeny based on small subunit rDNA (SSU rDNA) and glycosomal-3-phosphate dehydrogenase (gGAPDH) gene sequences. Morphological characterization included light and scanning electron microscopy. Besides the species already described, T. cruzi and T. cruzi marinkellei, were identify an unclassified species, Trypanosoma sp., identify into a bat species Pteronotus parnelliii. Phylogenetic trees using combined SSU rDNA and gGAPDH data sets clustered the trypanosomes of bats, which were highly divergent from other trypanosome species. The phylogenetic position made it possible to classify the trypanosomes from bats as a separate species. The bat trypanosomes isolates in Belo Monte Hydroeletric area were identified by phylogenetic analysis like as T. cruzi marinkellei, T. cruzi (TCI and TCbat) and into a bat species Pteronotus parnellii was identified a species unclassified. The diversity of bat trypanosomes in Brazil is underestimated and new studies should be conducted in brazilian biomes